针灸与中医的治病原理与西医迥异，好比经济学有宏观与微观经济学一样：西医注重微观研究或头痛医头、脚痛医脚的局部性治疗，而针灸与中医则强调宏观或全身性的诊治。针灸与中医用宏观的理论，将诸如：细菌、病毒、化学毒素、风害……等对身体有害的因素，通称邪（病）气，而将一切诸如：营养、维生素、氧气、血液、红白血球、抗体、益菌……等，对身体健康有益的因素，通称正（元）气。

身体的正（元）气足，则邪（病）气不侵，或侵入后被正气所消减；身体维持一个平衡和协的健康体系。身体的正（元）气不足，则邪（病）气入侵，正（元）气虚弱无力对抗邪气，破坏身体平衡和协的体系，而百病生。

人类历经生、老、病、死的生命过程，无时无刻不受不良饮食、睡眠（过多过少）、运动（过多过少）、休息不足、抽烟、酗酒、吸毒、细菌、病毒、化学毒素、风吹、雨打、日晒……等影响，让邪（病）气有机可乘，这时如果年轻力壮或正（元）气充足，则邪不胜正，身体尚可维持健康状态；如果年老体衰或正（元）气不足，则百病丛生。

西医偏重微观研究，治病重点在排除致病的邪（病）气，从细菌、病毒、组织器官到分子细胞、遗传基因、DNA……等，深入研究各种致病的因素及基理，并研发各种止痛药、抗生素、特效药……等，对排除致病的邪（病）气，发挥快速、有效率、普及、便利的效果。

而中医尤其是针灸则从宏观的理论，重视正（元）气的培固；强调恢复或提高身体的抵抗力、免疫力、或自疗能力 （Self-healing Power），乃治病强身的第一要务。中医、针灸、与气功有句名言：药补不如食补，食补不如气补。这句话的真谛：并不是鼓励病人生病不吃药，更不是要人练气不吃饭；而是主张治病强身应固本正元，先从「调控」气血或增强正（元）气或身体的抵抗力、免疫力、或自疗能力（包括睡眠、休息、运动、针灸等）著手，其次重视饮食营养，最后才以药物控制病情或治病。

因此，针灸的治病，先从调整气血开始。经络乃全身气血的循行通道，它循行全身，通达表里，贯穿上下，对身体有「调控」气血输送、营养内外的生理作用，并使身体重要组织及腑脏器官之间，保持和谐平衡。一但经络阻塞不通，必然会影响气血或正气输送的调控，让邪（病）气侵入，促使相关组织及腑脏器官发生病变。

而穴位又是「调控」经络的「枢纽」。当针灸的针（不论留针或不留针），经皮肤刺进穴位后，会产生「□麻胀重痛」等得气感；「凡走过的路必留下痕迹」，「凡扎过的穴位尤其是留针」，也必然会引起自律神经系统的一连串反应：如加速血液循环、促进免疫系统分泌、增加身体强壮与对抗疾病或痛苦的各种内分泌如 Endorphins等。通过针灸，让气血通畅；气血通则正（元）气足，正气足则身体的免疫力、抵抗力、或自疗能力增强，疾病自然消减。

西医也同意：百分之八、九十的病，靠身体本身的免疫力、抵抗力、或自疗能力，都可不药而愈。很多人误认针灸只能用来医治关节酸痛，而不知针灸可以调整气血，增强身体强壮与对抗疾病的能力，至少可以治疗几十种常见的疾病，譬如感冒、咳嗽、哮喘、过敏、胃肠系统病痛、呃逆、呕吐、腹泻、脱肛、痔疮、急慢性阑尾炎、高血压、中风、偏瘫、眩晕、心脑血管疾病、阵发性心跳过速、癫痫、频尿、尿闭、阳萎、遣精、各种沁尿及生殖系统疾病、失眠、头痛、面部神经麻痹、三叉神经痛、鼻炎、牙痛、咽痛、中耳炎、肩背病、腰痛、腿股痛、坐骨神经痛、关节酸痛、风湿、扭伤、麻木、发热、中暑、月经不调、经痛、经闭、白带、子宫下垂、胎位不正、盆腔炎、引产、催产、不孕症、落枕……等。了解针灸的治病原理，就不难明白：为甚么小小一根针，能治这么多病，真是打遍天下医疗体糸，无技（药）可比！

针灸最基本的治病原理在阴阳、五行及经络学说。人体除任督二脉之外，十二脏腑又各有一条经脉，这十二条经脉的循行方向，以六气阴阳分为少阳（阳气初生）、太阳（阳气大盛）、阳明（阳气极盛）、少阴（阴气初起）、太阴（阴气大盛）、及厥阴（阴气殆尽）。手上有三条阴经，从藏胸走手；三条阳经，从手走头。足之三阳，从头走足，足之三阴，从足走腹。

这十二条经脉的循行次序为：手太阴肺经→ 手阳明大肠经→足阳明胃经 →足太阴脾经→ 手少阴心经→手太阳小肠经→足太阳膀胱经→足少阴肾经→手厥阴心包经→手少阳三焦经→足少阳胆经→足厥阴肝经的顺序而复入于肺。这十二条经脉左右各一条共二十四条，再加任督二脉共二十六条经脉。

任脉、督脉、二条胃经、二条膀胱经更是人体六绦最重要经络，具贯穿头、颈、胸、腹、五脏 （心、肺、肝、脾、肾） 、六腑 （胃、大肠、小肠、膀胱、胆、三焦）、腰、背、及双脚的战略功能。

这六条经脉对人体的健康，就如同美国加州圣地亚哥 （San Diego） 的 5、8、15、805、78、 56、52、94号高速公路一样，对该市的人文、交通、经济、社会，具战略关键性功能。这几条高速公路一但发生阻塞，全市必陷入混乱。

同理，任督胃及膀胱经如有阻塞，全身气血循行与健康必受影响。确保这几条高速公路的畅通，乃促进该市政经发展的基石；打通这六条经络，也是治病强身的要理。

由于药会互相干扰，三焦有病（就是心或肺上焦。胃、肝、或肾中焦。大小肠、膀胱、或生殖糸统下焦等同时有病），不论中西医，群医必束手无策，病人也只能卧以待毙，只有针灸尚有一线希望。三焦有病，针灸师主张先治中焦，先让病人能吃能睡，如能打通这六条经络，使全身气血畅通，则培本固元，「也许」能稳住病情，再设法治疗上下焦的病。