日本《軍事研究》第11期刊發日本著名航空評論家石川潤一的文章《從轟-6A到轟-6K:中國“空中堡壘”的發展路徑與潛在威脅》稱,當前中國軍隊正式列裝部隊的轟炸機只有海軍的轟-6G、空軍的轟-6K,以及轟-6H和由轟-6F升級改造而來的轟-6M四種型號。此外還有幾款轟-6系列的派生機型,比如空中加油機系列中有從空軍轟-6A改造而成的轟油-6、由海軍轟-6D改造而來的轟油-6D等。飛機配備數量因航空團編制序列不同而呈現較大差異,每個團大約在12架到21架之間。
當前運用轟-6系列的是空軍4個戰區和海軍2個戰區,分別編成了空軍轟炸機師和海軍航空兵師。空軍的轟-6師包括中部戰區的1個轟炸機師、東部戰區的1個轟炸機師、南部戰區的1個轟炸機師以及北部戰區的哈爾濱航空學院。海軍的轟-6部隊分布在東部戰區(東海艦隊)所屬的1個海軍航空兵師和南部戰區(南海艦隊)1個海軍航空兵師。每個師具體配備的轟炸機數量如下。
中部戰區的轟炸機師編有2個航空團,配備轟-6H;東部戰區轟炸機師編有2個航空團,配備轟-6K和轟-6H,東海艦隊的海軍航空兵師編有1個航空團,配備轟-6G和轟油-6D);南部戰區的轟炸機師編有3個航空團配備轟油-6和轟-6K;南海艦隊海軍航空兵師編有1個航空團,配備轟-6G、轟油-6D。
中國軍方在2002年的珠海航展中公開了搭載鷹擊-8系列反艦和對地巡航導彈的轟-6F,該機型目前已升級為轟-6M,它具備強大的導彈攻擊能力,採用將將燃料罐嵌入彈藥倉的獨特設計結構。轟-6M在轟-6系列中擁有最長度續航距離,其作戰半徑達3500公里以上,即使去除有效載荷,作戰半徑依然能夠達到3000公里左右,可以往返關島。其主機翼下方各有2處彈藥掛載點,可搭載4發鷹擊-85空對地導彈。目前能夠確認正在服役的轟-6M只有5架。