根據史料記載，東突厥斯坦的維吾爾人的歷史可追溯到4000年以上。在這塊土地上，維吾爾人的祖先和其他的當地人民曾經建立過許多屬於他們自己的，獨立的王朝，使這塊土地擁有了繁榮昌盛的，輝煌的過去。位於絲綢之路中段的這塊土地上，維吾爾人在促進東西方文化的交流上扮演了極其重要的角色，並發展了他們自己的獨特的文化與文明。

同中亞的其他的突厥語系的民族一樣，在維吾爾人的早期歷史上，也曾經信仰過薩滿教，摩尼教和佛教。從公元一世紀直到伊斯蘭教來臨之前，東突厥斯坦是一個重要的佛教文明的中心。

維吾爾人和穆斯林的接觸並信仰伊斯蘭教是在9 世紀初開始，繼而於黑汗王朝時期成型的。當時的黑汗王朝的首都喀什噶爾很快就變成了一個以學習伊斯蘭教的主的文化中心。伊斯蘭教的先進的制度提升了地區的先進文明。開創了藝術、科學、音樂和文學作品領域方面繁榮。在這段時期，出現了數以百計有名望的維吾爾學者，誕生了上千部不朽的著作。其中，維吾爾學者玉素福·哈斯·阿吉普著的《福樂智慧》１０６９－１０７０；默哈默德·喀什卡爾了著的《突厥語大辭典》是最為著名的兩部著作。

清朝入侵

１７５９年，獨立的薩伊德王朝，又稱亞爾肯特王朝，被當時中國的統治者清朝入侵並以軍墾區的形式維持到１８６２。在這段時期，東突厥斯坦的維吾爾人和其他的當地人民為了重新獲得獨立與主權，與外來入侵者展開了英勇的，堅持不懈的鬥爭。共組織了４２次起義。最終於１８６４年趕走並建立了野特夏哈爾王朝，又稱七域之國。遺憾的是，這次獨立沒有持續太久。滿清政府於１８７６年再次入侵，經八年的浴血奮戰，東突厥斯坦於１９８４年１１月１８日　被正式劃入清朝的版圖，並且改名為新疆。

中國在東突厥斯坦的統治

滿清王朝於１９１１被國民政府推翻之後，東突厥斯坦落入了軍閥和滿清王朝的最後一個總督手中。此時，中央政府並沒有實際控制東突厥斯坦。維吾爾人，為重新獲得自由並在這種意志的激勵下，經過多次和長期艱苦的卓絕鬥爭，分別於１９３３年和１９４４年兩次建立了獨立的共和國，但是，這兩個政權在當地中國軍閥和中共的軍事入侵以及蘇聯的政治陰謀配合下被推翻了。

１９４９年，中國人民解放軍入侵並最終征服了東突厥斯坦共和國，剝奪了東突厥斯坦人民的命運。中共後來在這塊土地上建立了新疆維吾爾自治區。

東突厥斯坦自被中共統治以來陷入了歷史上最黑暗的時期，維吾爾人的生存權利受到了嚴重的威脅。中共政府為了實現其對東突厥斯坦的永久霸占，用盡了各種邪惡的手段來對付維吾爾及其他當地人民。

在自己的身份和生存權利受到中共慘無人道的破壞和野性般的威脅下，維吾爾人和其他的當地人民共同拒絕屈服於中共的統治，高舉着他們的祖先傳遞給他們的抗拒的火炬，與中共入侵者進行着不屈不饒的反侵略鬥爭。