１９２８年５月，陳翰笙夫婦回國，蔡元培有意邀他到中央研究院社會科學研究所工作，由於遭到王世傑反對，只好推薦他到商務印書館編譯所，負責審定《萬有文庫》有關書稿。１９３１年商務出版英漢對照的《百科名匯》，其中經濟學、社會學、歷史和宗教部分就是由他審定的。他還擠時間，就中國農民捐稅負擔問題，廣泛搜集材料，加以統計分析，寫成《中國農民擔負的賦稅》長篇論述，以充分事實，闡明中國的財政負擔差不多都放在農民身上。這是他早期關於中國農村經濟問題的重要文章之一。他還根據西歐、東歐、俄國、日本的社會發展過程，分析研究了封建社會的農村生產關係，分成賦役制、強役制、工商制，並具體分列出它們的異同，為研究封建社會的農村經濟提供了有價值的基礎知識，中央研究院社會科學研究所１９３０年作為農村經濟參考資料出版。

　　此外，中國２０年代由於軍閥混戰，西北大旱，各種災害頻仍，豫、魯、陝、甘等省農民大批向東北流亡，陳翰笙對東北的土地農民問題，也搜集材料寫專文在中央研究院社會科學研究所《集刊》第２號刊出。

　　１９２９年蔡元培正式邀請陳翰笙任中央研究院社會科學研究所副所長，並主持社會學組工作，為減輕阻力蔡以院長身份兼任所長，所內一切具體工作交陳翰笙主持。陳接任後，鑑於所內圖書資料極為缺乏，就答應鐵道部部長顧孟余之請，兼任鐵道部顧問，以其兼職月薪充實圖書資料。同時開展社會調查，搜集第一手資料。第一個調查目標，是上海日資紗廠的工人生活，揭露紗廠實行包身工制度下，包身工人身受帝國主義資本家和中國包工頭的雙重剝削。他將調查材料寫成小冊子加以揭露，這就引起代表賣辦資產階級的國民黨政府某些人的不滿，促使他轉向農村經濟調查，實現他在莫斯科工作時萌生的願望。陳翰笙的農村經濟調查，從江蘇無錫開始，再擴展到河北保定和廣東。其用意是，“江南、河北、嶺南是中國工商業比較發達，而農村經濟變化得最快的地方。假如我們能夠徹底了解這３個不同經濟區域的生產關係為何在那裡演進，認識這些地方的社會結構的本質，對於全國社會經濟發展的程序，就不難窺其梗概”。

　　１９２９年春，農村經濟調查團在無錫成立，全團４５人，採用挨戶調查的方法，調查全縣各種類型自然村的農村經濟實況。在無錫縣４鄉選定了有代表性的２２個自然村，計有１２０４戶。調查人員分成４組，由張稼夫、錢俊瑞、劉端生、秦柳方分任組長，調查內容包括農戶和生產的基本情況，以及租佃、借貸、典當、捐稅負擔、商業買賣、生活消費、文化教育等等，共用了３個月，挨戶調查結束後又調查了５５個自然村的概況和８個市鎮的工商業。其間陳翰笙曾親自陪同史沫特萊訪問了幾個自然村。

　　這項調查，是我國最初採用階級分析方法，了解農村生產關係的各個方面，以及生產力水平，農民的物質文化生活等，從而有助於認識半封建半殖民地的農村社會性質和農村革命的中心任務。無錫當時工商業比較發達，通過調查了解到：無錫農村地權比較集中，地租剝削占農民租入土地淨收入量的９３．１４％，貧農交租平均每人１２２．７斤，中農交租平均每人１１６．４斤，當時無錫農村還流行高利貸，年利率一般為５０％左右，多為實物借貸，借一石米，一年要還本利一石半。此外還有僱工剝削、捐稅，以及商業剝削，在封建半封建生產關係束縛下，生產力陷於停滯狀態，生產水平很低（水稻畝產僅４０１斤，小麥畝產１０５斤），人均收入很少（中農４７元，貧農２５元；米價每１００市斤８．４元，小麥每１００市斤５．０７元），生活極度貧困，１４歲以上人口中文盲占７３．４１％。

　　１９３０年又與北平社會調查所合作，對河北保定清苑進行農村經濟調查，選定１０個自然村１５７８個農戶的勞動力、僱傭農業勞動、工資、畜養、住房及農舍、水井和水澆地、耕地占有與使用、交租形式、複種面積和受災面積、各種農作物種植面積及收穫量、副業收入所占比重、外出人口職業收入等進行挨戶調查，並作了全縣以及幾個集鎮的概況調查。調查結果說明，土地仍集中在地主富農手裡，但集中程度略低於無錫。交租形式，則有分租、糧租、錢租，而以錢租為主。租額占產值的５６．６５％。保定地區僱傭剝削和高利貸剝削比較普遍，中農每戶平均負債３９．１０元，貧農負債平均每戶２１．２２元，僱農１６．９２元。隨着帝國資本主義的侵入，逐漸破壞了農村自給自足的經濟，廣大農民還受商業上的剝削，而且越來越重。

　　陳翰笙對這兩次的調查材料，還聘請王寅生、錢俊瑞、薛暮橋、姜君辰等參加整理。但調查報告寫出以後，中央研究院領導易人，未能正式發表，許多重要資料只有在陳翰笙和錢俊瑞、薛暮橋等發表的文章中透露，原始資料便保存下來。

　　調查發現，農村中計算土地面積的“畝”差異極大。陳翰笙在《畝的差異》一文中指出：“根據無錫２２村１２０４戶調查，知道無錫的所謂畝，大小不同，至少有１７３種，最小的合２．６８３公畝，最大的合８．９５７公畝，就是在同一村里，至少也發現有５種，邵巷一村就有２０種，小的合２．６８３公畝，大的５．６１６公畝。工業資本主義還不發達的中國，不可能有統一的度量衡，這樣複雜的差異，使浮徵稅捐的種種弊端更加厲害，同時使地主更可以浮收地租。”

　　１９３３年１１月至１９３４年５月底，他又組織對廣東農村的經濟調查，這次調查得到孫夫人宋慶齡及中山縣縣長唐紹儀等的支持，進行得很順利。調查人員由中央研究院社會科學研究所、中山文化教育館和嶺南大學共同組成。首先對梅縣、潮安、惠陽、中山、台山、廣寧、英德、曲江、茂名等１６個縣進行詳細調查，歷時三個半月；而後用一個半月時間對番禺１０個代表村的１２０９戶進行挨戶調查，同時還進行５０個縣３３５個村的通信調查。陳翰笙根據調查結果寫成《廣東的農村生產關係與生產力》指出：“勞動力在廣東這樣不值錢，而全省可耕而未耕地竟占陸地面積的１５％，兵災匪禍更使已耕的田地很多被荒棄。有可用的人力而不用，香港、廣州、汕頭等處的銀行、銀號中堆積着大量貨幣資本而不能用到農業生產上去。這便是農村生產關係與生產力的矛盾。耕地所有與耕地使用的背馳，乃是這個矛盾的根本原因。”並指出“農村勞動力沒有出路，更體現着這個矛盾的深刻。解除這個矛盾，然後可以使可耕的土地儘量地開發，可用的人力合理地利用，可投放的資本大批地流轉於農村，這樣，農村的生產關係便能改善，而農村生產力也會必然提高。這樣，中國今日的農村便不難從危機中挽救過來。”這本小冊子後來被譯成日文在日本出版。

　　１９３３年，太平洋國際學會打算出版一套叢書，反映國際資本對各國人民生活的影響。陳翰笙抓住這個機會，又一次與中山文化教育館合作，組織王寅生、張錫昌、王國高等對山東濰縣、安徽鳳陽、河南襄城３個煙草產區、１２７個農村進行了實地調查，並從中選出６個典型村４２９戶進行挨戶調查，這項調查歷時兩年完成。陳翰笙又從美國搜集了大量有關資料，於１９３９年用英文寫成《工業資本與中國農民——中國煙農生活研究》一書（１９８５年復旦大學出版的《陳翰笙文集》有摘錄）。

　　當時，英美煙草公司在中國設廠大規模生產紙煙，壟斷中國的煙草市場。陳翰笙通過烤煙產區的調查，反映出國際壟斷資本同代表買辦資產階級的中央與地方政權，以及軍閥官僚、土豪劣紳、奸商高利貸者相互勾結，剝削壓迫農民的真實畫面。一般認為商品作物的推廣會有助於資本主義的發展，而在半封建半殖民地的舊中國，種植美國良種烤煙的大多數是貧農和下中農，而富裕中農和富農不需要借貸，也不熱心種那限價收購的烤煙。這是對中國煙草產區調查的新發現。

　　陳翰笙通過對中國各地的農村調查，清楚地認識到：“中國社會，純粹的封建已成過去，純粹的資本主義尚未形成，是正在轉變時期的社會，在這種社會裡，土地所有者和商業資本及高利貸資本三者均以農民為共同剝削目標”。後來，他更明確地認定：“這就是半封建半殖民地的社會，廢除封建的土地制度，進行土地革命，使無地少地的農民得到土地，是發展農業生產，解決農村問題唯一正確的道路”。

　　１９３３年８月，他出席在加拿大召開的太平洋國際會議，在會上提出的論文，題為《現代中國的土地問題》。利用各地調查材料說明土地分配不均，少數地主富農占有大量土地，廣大貧下中農無地少地，遭受地主富農殘酷剝削，使農業生產力低下，農村經濟貧困現狀，為中國共產黨領導的民主革命路線，作了理論上的論證，在國際學術界引起重視，認為《中國土地問題》是權威之作。

主要論著

　　１．陳翰笙．《五口通商與茶葉貿易》．美國芝加哥，１９２１年．

　　２．陳翰笙．《瓜分阿爾巴尼亞的１９１１年倫敦使節會議》．德國柏林，１９２４年．

　　３．陳翰笙．《人類的故事》．北京北新書局，１９２５年．

　　４．陳翰笙．《國際新局面》．北京北新書局，１９２５年．

　　５．陳翰笙．《封建社會的農村生產關係》．上海：國立中央研究院，１９３０年．

　　６．陳翰笙．《東北的難民與土地問題》．上海：國立中央研究院，１９３０年．

　　７．陳翰笙．《現代中國的土地問題》．上海：國立中央研究院，１９３３年．

　　８．陳翰笙．《廣東農村生產關係與生產力》．上海中山文化教育館，１９３４年．

　　９．陳翰笙．《中國的地主和農民》（英文版）．美國紐約，１９３６年．

　　１０．陳翰笙．《工業資本與中國農民》（英文版）．美國紐約，１９４０年．

　　１１．陳翰笙．《中國資本與內戰》．美國紐約，１９４６年．

　　１２．陳翰笙．《中國農民》（英文版）．印度孟買，１９４６年．

　　１３．陳翰笙．《中國工業合作運動》（英文版）．美國紐約，１９４７年．

　　１４．陳翰笙．《西雙版納的土地制度》（英文版）．美國紐約，１９４９年．（１９８５年社會科學出版社再版）．

　　１５．陳翰笙．《美國壟斷資本》．北京世界知識出版社，１９５５年．

　　１６．陳翰笙．《印度和巴基斯坦經濟區域》．北京商務印書館，１９５９年．

　　１７．陳翰笙．《印度莫臥爾王朝》．北京商務印書館，１９７９年再版．

　　１８．陳翰笙．《陳翰笙文選》．上海復旦大學出版社，１９８５年．

　　１９．陳翰笙．《解放前的中國農村》１—３輯（與薛暮橋、馮和法合編）．北京展望出版社，１９８５．１９８６．１９８９．

　　２０．陳翰笙．《解放前後無錫、保定農村經濟》（與薛暮橋、秦柳方合編）．農林漁業部農村經濟管理幹部學院研究所，１９８８年．