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针对外界呼吁两岸应联手保钓，台湾外交部表示，在中国大陆未正视中华民国存在之前，双方没有互信基础，并无可能。

针对中、日、台3方都宣称拥有钓鱼台列屿主权，争议无法解决，外交部6月1日重申，钓鱼台列屿是中华民国领土，台湾的附属岛屿，中华民国对钓鱼台列屿一贯立场是「主权在我，搁置争议，和平互惠，共同开发」，这也是马英九总统所提出「东海和平倡议」的主要原则。

至于外界呼吁两岸应合作捍卫钓鱼台列屿主权，外交部强调，两岸合作须有互信基础，若一味否定中华民国在光复台湾（包括钓鱼台列屿）所作的历史贡献，以及保护台湾渔民所作的长期努力，恐难创造联手保钓的有利条件。

外交部表示，除了缺乏互信之外，两岸对于解决争议的构想不同，双方对于《中日和约》看法也不同，以致迄今难以合作。

外交部以去年台、日签署渔业协议为例指出，传统的观念是主权与渔权不可分，但《台日渔业协议》采取现代观念，也就是主权不可让步、但可搁置，先处理渔权争议，待条件成熟时再处理主权争议。

台湾渔民殷切希望先解决渔业争议，台湾政府亦认为如此较有利。根据统计，签署前一年双方海域争议有17件，去年只有1件。台湾渔民在钓鱼台海域的捕获量增为3.6倍，价值增为2.9倍。

但是，中国大陆并不赞成台湾先解决渔权争议的作法，因此反对《台日渔业协议》。

外交部进一步指出，1895年日本取得钓鱼台列屿主权的唯一法律依据就是《马关条约》的割让，1941年珍珠港事变后我国对日宣战，就已宣示废止。二战后，台湾用1952年《中日和约》第4条正式废止《马关条约》，并溯及1941年生效。这也是台湾光复台湾正式的法律依据，更是攸关国家主权、民族大义的历史文献。

但是，中国大陆1972年与日本建交时，竟要求日本废止《中日和约》，双方看法大不相同。

外交部表示，中国大陆若没有正视台湾的存在，双方没有互信基础，恐难创造联手保钓的有利条件。