1916年6月袁世凱死後，由黎元洪繼任大總統，《臨時約法》與國會得以恢復。袁世凱的手下段祺瑞被任為國務總理。後國會又補選袁世凱另一手下馮國璋為副總統，他和段祺瑞分別控制直、皖兩派勢力，彼此勾心鬥角。時中央政府實權為段祺瑞所掌握，黎元洪手中無兵，乃聯馮以制段，於是中央政府遂出現「府(總統府)院(國務院)之爭」。列強亦介入其間，日本扶植段祺瑞，英、美等支持黎元洪、馮國璋。1917年，日本鼓動段祺瑞政府對德宣戰，段祺瑞想以武力脅迫黎元洪和國會同意參加歐戰案。黎元洪便於5月將段祺瑞免職，段祺瑞則令屬下各省督軍宣布獨立，並在天津設「獨立各省總參謀處」，擬進兵北京。
黎元洪因情勢危急，乃電召安徽督軍張勳入京調停。1917年6月，張勳率軍五千北上，路過天津時曾與段祺瑞磋商，段祺瑞欲藉張勳之手解散國會、驅逐黎元洪，因而對之佯示支持，極力慫恿其入京。張勳遂在天津通電迫黎元洪解散國會，旋即擁兵入京。7月1日凌晨，張勳、康有為等迎清朝末帝溥儀出御太和殿，改民國六年為宣統九年。張勳受命為議政大臣、直隸總督兼北洋大臣，北京城重掛前清黃龍旗。此乃民國建立後第二次恢復帝制，史稱「張勳復辟」。
宣統復辟稱帝時，黎元洪逃入日本使館，一面電請馮國璋代總統之職，一面被迫重任段祺瑞為國務總理。段祺瑞見國會已解散，黎元洪已被驅逐，遂轉而出兵反對復辟，自任討逆軍總司令，率兵進攻北京。7月12日，段祺瑞率軍入京，張勳遁入荷蘭使館，溥儀再次退位。此次復辟僅歷時十二天即告夭折。
民國成立後短短數年，便先後發生袁世凱稱帝及張勳復辟的鬧劇，可見中國由君主專制轉入共和政體的道路，見多麼的崎嶇曲折。
