港大医学院微生物学系自97香港爆发全球首宗禽流感后，一直钻研禽流感病毒的特性和变种趋势，该学系的实验室更是目前世卫组织在全球指定的7个专责确认人类感染H5禽流感病毒个案参考实验室的其中之一。是次国家农业部和卫生部高调批评港大微生物学系的研究理据和科学性和可信性，实验室的国际声誉及国家对其信任亦受影响。

中国代表陈冯富珍刚当选世卫组织总干事，据了解，中国的医学科研单位会否被推荐成为推行世卫工作的协作中心(Collaborating Centre)，除了世卫的邀请外，亦很视乎中央政府是否的批准，香港与中国虽然一国两制，但在世卫的名单中乃隶属中国之下，故香港的医学科研单位能否获批准成为世卫的协作中心，仍要中央支持。

有消息指，是次港大微生物学系的研究被国家农业部及卫生部高调反驳，狠批其不科学、无理据、不真实，一定程度削弱了国家对此实验室的信任，「或者较难获国家支持成为世卫协作中心」，其国际声誉亦受一定影响。

至于此事会否影响内地跟港大「新发传染性疾病国家重点实验室」的合作，熟悉北京政情人士表示，「应该不会」，因为自SARS爆发后，无论是广东省或中央卫生部与港大的合作都十分良好，而今次的回应主要是针对管轶。

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