據美國信息科學研究所(ISI)基本科學指數(Essential Science Indicator) 數據庫2009年11月1日最新數據顯示，中國科學院過去10年(1999年1月1日至2009年6月30日) 發表SCI論文數12萬3593篇，首次超過俄羅斯科學院（12萬3480篇），躍居世界科研機構和大學第一名。美國哈佛大學(9萬7011篇)，德國馬普協會（7萬0336篇）分列3，4名。總引用次數方面，中科院以77萬5040次，在全球排21名，在全國科研機構、高等院校則高居榜首。

 

篇均引用次數有所改觀，由去年的5.63次/篇升至6.27次/篇。引用次數少，特別是篇均引用次數少，一方面反映了論文的影響力較小，另一方面也與新增論文占的比例較大，引用高峰期滯後有關。預計論文引用情況將在今後3－5年左右的時間內有較大的改觀。此外，有不少中科院的學者將中科院的英文名稱（Chinese Academy of Sciences）寫成Academia Sinica（台灣“中央研究院”英文名稱），也影響了中科院的SCI論文統計數據。過去十年台灣“中央研究院”發表SCI論文數1萬1529篇，總引用次數11萬4140次。

 

主要學科具體情況如下：

 

一、化學領域

 

SCI論文總數3萬2784篇，首次超過俄羅斯科學院（3萬2499篇）躍居首位，遙遙領先於德國馬普（1萬1175篇）和法國CNRS（8267篇）；SCI引用總次數達到24萬8679次，比三年前（9萬4730次）增加163%，超越德國馬普協會（19萬5651次）和加州大學伯克力分校（13萬9202次），排名1位。篇均引用次數由去年的6.72次/篇提高到7.59次/篇，在全世界上榜的919家單位中排名750名。

 

二、物理領域

 

SCI論文總數2萬6255篇，仍排在俄羅斯科學院（3萬0741篇）之後，在全世界科研單位中排名第2位；SCI引用總次數達到15萬5312次，排名第4位，與排在首位的德國馬普協會（25萬4051次）仍有較大差距。篇均引用次數為5.92次/篇，在全世界上榜的667家單位中排名631名。

 

三、地球科學領域

 

SCI論文總數9025篇，在全世界科研單位中排名第2位；排在中國科學院之前的仍然是俄羅斯科學院（1萬3823篇）。SCI引用總次數達到5萬7439次，排名由去年的全球8位升至第6位。篇均引用次數由去年的5.84次/篇上升至6.36次/篇，在全世界上榜的435家單位中排名420名。仍有很大的上升空間。

 

四、環境與生態領域

 

SCI論文總數4857篇，首次超過USDA（4724篇），在全世界科研單位中排名第1位。SCI引用總次數達到2萬7289次，比三年前（6957次）增加292%，排名升至12位。篇均引用次數由4.90次/篇升至5.62次/篇，在全世界上榜的524家單位中排名521名。

 

五、數學領域

 

SCI論文總數2491篇，在全世界科研單位中排名第3位；SCI引用總次數達到8540次，排名由原來的11位升至8位。篇均引用次數由去年前的3.07次/篇升至3.43次/篇，在全世界上榜的189家單位中排名149名。

 

六、生物與生化領域

 

SCI論文總數5615篇，在全世界科研單位中排名由去年的第5位上升至第4位；SCI引用總次數達到3萬7429次，排名由去年的102位升至79位。篇均引用次數由5.91次/篇升至6.67次/篇，在全世界上榜的697家單位中排名690名。

 

七、計算機科學領域

 

SCI論文總數2019篇，在全世界科研單位中排名由去年的第5位升至第4位；SCI引用總次數3628次。篇均引用次數由1.65次/篇上升至1.80次/篇，在全世界上榜的328家單位中排名317名。