金針菇對健康的好處多多，但鮮金針菇不好儲存，做起來口感容易變老，很多人更願意購買儲存方便、口感更好的金針菇罐頭，不過還是建議儘量少買這樣的金針菇吃。
把金針菇做成罐頭，關鍵的一個步驟是將金針菇煮熟，這樣處理的結果就是：金針菇不再呈現好看的白色，而是顏色發暗，外觀受到很大影響，一些不法商家就可能在這方面動手腳。
有些不法商家可能會用硫磺熏制等方法先處理一下金針菇，然後再煮熟，讓金針菇美容增白。但如果使用了工業硫磺(有致癌作用)、連二亞硫酸鈉(有強烈刺激作用，會損傷人的眼睛和皮膚黏膜)等非法添加劑，對健康的損害就很大。而且，為了延長金針菇的保質期，浸泡金針菇的“營養水”也可能被不法商販做手腳。如果是正常加工生產的金針菇罐頭，浸泡湯汁很清亮，如果湯汁渾濁，雜質也多，建議大家不要購買，很可能添加了不該添加的東西。
金針菇菌蓋嫩滑、營養豐富，要吃就得吃新鮮的。新鮮金針菇分黃色和白色兩種，黃色金針菇應該是淡黃色或黃褐色的，頂端的“菇帽”中間顏色較深，菇柄顏色上淺下深，而白色金針菇是淡白或乳白色的。需要注意的是：不管是哪種金針菇，顏色都不會特別鮮亮。如果偶爾買罐裝的，注意三點：包裝上須有QS標註，是正規廠家出產的；如果湯汁要清亮；如果菇帽完全長開或開裂，說明金針菇已經老了或不新鮮了。
