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758阿拉伯和波斯水手劫掠廣州，被平叛。據《資治通鑑》記載，ysl創教才149年，就開始攻擊中國
760揚州穆斯林商人叛亂，百姓驅逐阿拉伯商人。
801穆斯林（阿拉伯和撒馬爾罕軍隊）從南亞方向攻擊唐朝，失敗，殘兵約一萬在雲南省境內向唐軍投降。
1277年，被宋朝任命任為泉州市舶司的回教徒蒲壽庚叛變宋朝，投靠元庭，殘殺宋朝皇室及僕從約五千到一萬人，拋屍。
1335元朝皇帝頒布聖旨，規定伊斯蘭教必須被稱為“清真教”。
1377改信伊斯蘭的蒙古—突厥將軍枯木兒開始征服中亞、中國西域的戰爭
1405帖木兒死，結束了帖木兒為“伊斯蘭”而征服中國的一攬子計劃。
1513哈密穆斯林叛亂，明失哈密，中國暫時失去對西域的統治權。
1514陝西穆斯林叛亂，穆斯林襲擊陝西。
1525西域動亂，西域穆斯林在甘肅省定居。
1573—1612中國西北穆斯林先後七次叛亂，攻擊明朝西域居民及部隊。
1642伊斯蘭教徒王岱輿撰寫了現存最早的一部漢文伊斯蘭教著作；用漢字寫伊斯蘭教書籍開始。
1646甘肅穆斯林叛亂，米喇印和丁國棟為首，被平定。
1648甘肅穆斯林叛亂，清軍平定之，其頭領斬立決。
1671未經政府允許，納合西班底蘇非兄弟會滲透到中國西北，私自傳教。
1722穆斯林文獻開始編制“穆罕默德出現在唐皇的夢中”的謊言，並將此歸結為伊斯蘭教傳入中國的原因。
1755一1762清政府統一準噶爾、南疆。
1761國外穆斯林精心培養的馬明心離開也門，滲透到中國，在甘肅傳播納合西班底“新教”（哲赫忍耶）；引發穆斯林“新教”與“舊教”內部衝突，鬥爭，並引發中國其他地區穆斯林參與內鬥。
1781新教穆斯林暴亂；因穆斯林內鬥，危害治安，政府逮捕馬明心；武裝信徒們試圖劫獄救援馬明心；馬明心被殺，其信徒被鎮壓。
1783乾隆皇帝下令審查漢文穆斯林經籍；穆斯林採用欺騙手段，宣稱清真寺意為“清朝皇帝是真主”的廟宇，收買審查官員，並提供偽經書供審查。後得逞，允許繼續著述。
1784哲赫忍耶穆斯林在田五阿訇帶頭下，對外宣稱為馬明心復仇，在甘肅東部展開穆斯林叛亂，被平定。清政府禁止穆斯林教。
1817瑪哈圖木阿雜木穆斯林在西域首次叛亂，1816年被平定。
1818雲南首次穆斯林叛亂，亂軍攻占省城，屠殺漢人，被平定，叛亂首領斬立決。
1820西域穆斯林叛亂，甘肅穆斯林叛亂，皆被平定。
1821雲南回族穆斯林暴亂，被平定。
1825—1827西域穆斯林叛亂，被平定。
1826—1828雲南西部回族穆斯林暴亂，被平定。
1834清政府鼓勵內地百姓向西域移民。
1839雲南穆斯林暴亂，被平定。
1845雲南穆斯林暴亂，被平定。西域穆斯林叛亂。
1846雲南穆斯林暴亂，被平定。
1847雲南穆斯林暴亂，被平定。
1855西北回族穆斯林叛亂。輪台維吾爾穆斯林叛亂，甘肅撒拉族穆斯林叛亂。
1855雲南穆斯林暴亂，在大理建立穆斯林國。被平定。
1862《古蘭經》首次在雲南被譯成漢文。
1862—1877西北回族穆斯林暴亂。屠殺漢人2000萬。哲赫恩耶首領馬化龍和陝西十八營穆斯林武裝力量是反叛核心。清朝總督左宗堂平定叛亂。
1866—1874喀什噶爾突厥人穆斯林統治者阿古柏在英國、俄國和奧斯曼人支持下入侵西域，建立“穆斯林政權”，於1877年被平定。
1871自稱為“救世主”的穆斯林新教頭領馬化龍，死。
1873雲南回族穆斯林暴亂，被平定。
1877清軍入疆，消滅阿古柏叛亂政權。
1895甘肅東部穆斯林內亂，內鬥，長達18個月。為穩定地方治安，清政府派軍平定暴亂。
1906—1908穆斯林阿訇王浩然在伊斯坦布爾同奧斯曼蘇丹阿布都?哈米德二世取得聯繫，為國外穆斯林進一步滲透中國鋪墊道路。
1907蘇丹派兩名土耳其官員、突厥神學家到北京傳教。
1912王浩然創建中國回教俱進會。（該組織性質未經考證）
民國初年，西域寧邊城（今西域昌吉）穆斯林屠城。
1928西北回族穆斯林暴亂，馬仲英為首，反馮玉祥，持續兩年，後被平定。
1931中國的穆斯林到埃及愛資哈爾大學學習；《古蘭經》漢譯第一次由王靜齋阿訇全部完成。
1943哈薩克族穆斯林西域暴亂。
1944維吾爾一哈薩克一烏茲別克族穆斯林西域暴亂，建立伊斯蘭教“東土耳其斯坦共和國”。
中華人民共和國時期（50——現今）
1951年，馬匪步芳舊部叛亂，被解放軍迅速平定，上萬名馬匪被擊斃；
1958 年青海省循化縣發生武裝叛亂；
1958年甘肅的廣河、東鄉等地發生大規模反革命叛亂；
1958年3月至8月，甘、青省內一部分反動的宗教上層分子和部落頭人、為了維護其封建統治和本階級的利益，在帝國主義和西藏反動集團的唆使下，掀起了反革命武裝叛亂。先後參加叛亂的有13萬餘人,叛亂地區達42萬平方公里。蘭州軍區堅持了以軍事打擊，政治爭取和發動群眾相結合的方針；在戰術上採取了以集中對集中，以分散對分散，集中與分散相結合的原則；採取由近到遠、由東向西、由北向南，先農業區後牧業區的平叛步驟。勝利進行了平叛作戰，共殲滅叛匪11.6萬餘人，收繳各種槍70000餘支。
1962年西域伊犁地區發生大規模騷亂。
2009年烏魯木齊七五事件。
