彈道導彈射程遠、速度快、突防能力強、毀傷效果好，優勢明顯，用它進行遠距離打擊敵方航空母艦，提高自身反介入能力確實是一個不錯的選擇。但是在實際作戰中使用要想在茫茫大海中使用彈道導彈打擊航空母艦也存在眾多困難。
第一關：探測關
這裡首先要澄清一個概念，在一般人眼中，航空母艦及其編隊多擁有10多艘各型艦艇，浩浩蕩蕩，似乎在海面占據很大一片面積，而航空母艦的飛行甲板面積動輒就相當於幾個足球場那麼大，似乎是一個非常大的目標。可是，如果把它們放在大洋海域中就顯得微不足道了。例如僅太平洋的面積就達1.797億平方千米，即便是大型航空母艦，放在這麼廣闊的水域裡也只是“滄海一粟”，由此可見，使用普通的偵察探測方法是很難發現它們的。
有一個典型的例子，一個國家曾經拍攝過太平洋關島以西海域一艘航空母艦航行時的衛星圖片，這幅照片是62500×8333像素大小的，遠比一般的數碼照片清楚幾十倍，但航母在照片中不過只是一個難以分辨的像素點，也就是說，在廣袤的大洋中如何發現航母，其實是導彈導彈打航母的第一個難題。
第二關：鎖定關
此外，即使能夠發現航空母艦及其編隊，之後還存在着如何繼續跟蹤，以及對航母事實攻擊前如何準確定位的問題。偵察衛星限於其運行軌道的局限，很難對編隊進行長期跟蹤，而負責為彈道導彈進行目標導引和標定的艦載機在方圓數百海里的廣闊的洋面上如何對各個區塊進行偵察和跟蹤，也是一個難題，想要真正鎖定航空母艦，實際上並不容易。
第三關：制關導
最後，普通的彈道導彈通常採用具有極大威力的核戰鬥部和大當量常規戰鬥部，因此採用的制導方式和圓概率誤差都比較大，往往超過100米，而如果要準確命中航空母艦，就必須採用更準確的制導方式，去縮小圓概率誤差，這就給彈道導彈的制導，特別是末制導帶來了難題。
難題1：彈道導彈從太空返回大氣層的飛行速度極高，達到10~20個馬赫，從大氣層再入直到高度降低到海平面，時間只有短短的十幾分鐘，要進行末端制導和調整非常困難。
難題：2：彈頭在高速飛行中，會在彈體表面形成一個電離層，這層等離子體導致彈體與外界信號隔絕，末制導雷達無法工作，當電離屏蔽消失後，實際上彈道導彈已經降低到了很低的高度，末制導雷達能夠工作的時間已很有限。
難題3：彈道導彈再入時的飛行姿態是垂直向下，一般只能從上而下打擊艦船的甲板及上層建築，其彈道不同於掠海飛行的反艦導彈，毀傷效果可能不如後者。
結語
值得欣喜的是我國在這方面已經取得重大突破，2016年二月份，央視首次公開了DF-21D反艦彈道導彈發射時的彈體實圖，多年傳說終被證實，這為我國領土安全又提供了一重新的保障。
