就馬大為kaitocephalin全合成細節與求實2商榷 |
送交者: 深秋十月 2006年06月08日14:39:15 於 [教育學術] 發送悄悄話 |
就馬大為kaitocephalin全合成細節與求實2商榷 深秋十月 求實兄發表《邀請深秋十月來我的實驗室驗證馬大為的造假》已經有幾天了。一直忙,不能坐下來好好寫。現在先把一些想法大致寫出來,請求實兄過目。一聲雷在《馬大為的JACS論文假象橫生》中提的問題和求實兄的重複,算是順便答覆了。 我的理解,求實兄的發言主旨是認為馬大為的kaitocephalin全合成工作屬於造假,依據有三,一是倒數第二步是單純的脫保護,1位羧基保持,二是最後一步中不可能發生消旋化,三是合成步驟中的Jones氧化會導致Boc保護基脫去。我認為求實兄的依據是不成立的,因此結論也有問題。以下詳述。 關於倒數第二步反應,我認為在脫保護的同時1位羧基發生酯化。求實兄認為羧酸在含有水的介質中不能發生酯化反應,但這並非事實。馬大為的反應體系中有羧酸、甲醇、水和鹽酸,正是酸催化酯化的條件。這是一個可逆反應,產率取決於起始條件和平衡常數。 以下文獻中報道了在含水和稀鹽酸的體系中測定甘氨酸與乙醇間酯化反應平衡常數的工作: 另外,也有在含水體系中測定脂肪酸和醇間酯化反應平衡常數的報道: 我們無從得知kaitocephalin與甲醇的酯化反應平衡常數,不過從以上這兩篇文獻推斷,設為4可能比較合適。馬的反應體系含有羧酸0.1毫摩爾,甲醇49.4毫摩爾,水27.8毫摩爾,氯化氫1.0毫摩爾,由此計算,在反應達到平衡時羧酸酯的產率為86%。 因此,即使體系中有水存在,酯化反應仍有可能給出相當高的產率。而且以上數字與馬的三步總產率92%相差不遠。 至於最後一步消旋化的問題,以上已經說明這一步的原料是羧酸酯,而羧酸酯的鹼催化消旋是很常見的。馬大為在2002年的更正中似乎認為這個消旋化的機理有新穎之處,我就不越庖代廚了。順便說一下,求實兄提到的D. A. Evans的3-羥基-2-氨基氨基酸的2位相當於kaitocephalin的4位,而馬大為的消旋是在kaitocephalin的2位,因此二者無法直接進行類比。 關於Jones氧化,事實上文獻中有不少用Jones試劑氧化2-Boc氨基醇的報道,求實兄的質疑並不成立。以下列出幾篇最近的報道: 因此,我認為求實兄的結論缺乏依據。呵呵,重申一下,我看重的是證據,反對的是沒有根據的打假。所以現在我還無法接受求實兄的邀請。不過,如果日後求實兄發現了造假的確鑿證據,我肯定會毫不猶豫地接受邀請,並大力支持求實兄的努力。
關於上海有機所馬大為JACS文章(J. Am. Chem. Soc. 2001,123, 9706-9707.) 由馬大為JACS文章看到,合成kaitocephalin設計是2位S-構型氨基酸。這一 由馬大為JACS文章更正,最後一步反應發生了預想不到的消旋化,得到了 Kaitocephalin的1位為羧酸,2位為R-構型氨基,3位為S-構型羥基。馬大為 馬大為在JACS文章報道用1N氫氧化鈉水解oxazolidinone環收率為92%。馬大 此反應條件下,2位的氨基非常穩定,不能產生1/1的消旋化產物。我們曾經 推敲馬大為JACS文章的合成反應,馬大為兩次以較好收率用Jones氧化反應 由馬大為JACS文章的光譜數據看,馬大為沒有完成即使是消旋化 我於1990年就進入世界著名的製藥公司做新藥研發,而3-羥基-2-氨基氨基 我回答深秋十月《馬大為造假不等於失誤》。同時,我邀請深秋十月能來我 (XYS20060531) |
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