夏雨天的<呼籲完善制度───也論ＸＹＳ的“倒掉”>, 講了以下幾個問題:
1. 方舟子學術打假有誹謗嫌疑.
2. 學術腐敗的根本原因是缺乏完善的制度.
3. 方舟子的打假弊大於利.
總體上要說明的問題是:根除學術腐敗必須儘快建立完善的學術制度, 而不是搞什麼學術打假.

我想, 此文的論點只能一分為二地看, 根除腐敗必須儘快建立完善的學術制度, 當然是沒有錯的, 我也胡亂寫了寫東西, 說了這個問題. 但如何認識學術打假, 我不同意夏雨天的看法. 根除學術腐敗, 建立完善的學術制度是治本, 搞學術打假則是治標, 治本固然重要, 治標也不可忽視, 就好比得了病消除炎症固然重要, 退燒止痛也必不可少一樣(我不是學醫的,不知道這個比方是否恰當).

方舟子學術打假過程中是否有誹謗行為, 我不想討論. 但是我覺得, 即便存在誹謗, 也不該成為否定學術打假的理由. 如前所述, 對於學術腐敗, 學術打假起到治標的作用, 是必須的. 如果再打假過程中產生了新的問題, 我們應該考慮如何規範學術打假(換言之, 學術打假也要受到制度的制約), 而不是禁止學術打假.