中科院的新中心大楼不用“华罗庚”这个众志成城的名字，而由丘力主，让丘的朋友出资几百万冠以朋友的“思源”的大名。1998年，正值中国数学会申办2002年ICM（国际数学家大会）主办权的关键时刻，丘采取了另搞一套的做法，倡议成立“国际华人数学联盟”和召开ICCM（国际华人数学家大 会），同中国数学会争夺领导权。
中国数学会曾就此事同丘成桐协商，希望团结一致共同把申办工作和ICM大会的筹备工作搞好。但丘傲慢而愚蠢地加以拒绝。说他愚蠢是因为他完全不懂IMU（国际数学联盟）的规章，申办和主办都必须由所在国的数学会与IMU合作进行。换言之，他另搞一套的做法根本行不通。
但是丘藐视中国数学会的态度立即造成中国数学界的混乱，并引起大多数中国数学家的不满。由于申办和举办 ICM已被认定为国家行为，中央十分重视，由科技部下达正式文件，表明：不宜成立“华裔数学家联盟”以及希望丘成桐教授采取某些适当的方式推迟华裔数学家大会（ICCM）的召开。对此丘采取了激烈的对抗，策动香港数学会代表在会上提出把举办地点从北京改为香港的动议。当时的香港代表及时向当时的中国数学会理事长马志明院士透露了丘成桐教授的计划。在了解了事实真相后他表示香港数学会将同中国数学会保持一致，决不做损害国家利益的事。会议最终以压倒多数通过 ICM2002在北京举行的决议，丘的计划遭到挫败。为此丘断绝了与该香港教授的关系，并对之多方打击报复。在中国数学会领导下和全国数学家的共同努力下，ICM2002在北京如期召开并取得了巨大成功。在这过程中丘采取了不合作的态度，拒绝中国数学会多次邀请，坚决不参加大会。
马志明院士是继陈景润之后得到在苏黎世举行的世界数学家大会45分钟报告邀请殊荣的中国数学家（同时受邀的还有张恭庆院士）。当时，马院士在科学院内部众望所归，除了他大家甚至找不到可以担任中科院数学院院长的合适人选。可是，由于在北京举办世界数学家大会的过程中马志明得罪了丘成桐，丘成桐和杨乐在中科院大打大闹，影响极坏，要求其他人出任这个数学院院长的职位。马志明心灰意懒，遂把这职位交给自己都没做好准备的郭雷。经历了文革严霜的中国数学界刚刚恢复了一点元气，丘成桐和杨乐酝酿的政治战争又开始了。
