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基因组研究出现后，成为生物学中争议最大的热点。但是无论反对的多强烈，基因组研究是越来越在生物学中占主导地位。更有很多科学家，特别是物理，数学家欢呼基因组将标志真正生物学革命的到来。我个人是赞成这一种观点的，理由如下：

1)首先是根据对生命是什么的判断作出的。生命是什么，这是个非常古老的哲学问题和科学问题。历来存在两类极端的观点。一类认为生命不过是些自然中存在的偶然现象。因此对生命的研究就是以发现为主导的。这类人是广义的博物学家，其中以达尔文为代表。他们认为只要把对生命的观察简单综合分析，就能理解，就能解决连物种怎么起源的这类大问题。可以说，经典的生物学(包括分之生物学)基本上都是为这类观点主导的。

2)另一类完全不同的观点是：生命可能是宇宙中最复杂的现象。生命中可能包含人类现在都还不了解的基本原理。因此，生命的本质不可能通过简单归纳一些现象得到解决。在这种判断下，以前的生物学基本上可以被称为博物学，甚至连真正的科学都算不上。

3)由于手段的贫乏，以前生物学观察到的都是非常局部，线性的现象。因此导致第一类观点占上风。这也是为什么象达尔文的错误百出的进化论会这么风行一时。但是，基因组研究(包括序列基因组，功能基因组，结构基因组等)使得人类第一次得窥生命现象背后的极端复杂性。就现在非常初步的结果看来，生命的本质实际上就是我们还不了解其性质的巨大相互作用网络。这种网络的行为才是生命的本质所在，以前的传统生物学观察可能只是触及皮毛。达尔文的理论基本上就是一种天真的儿童式思维的结果。

4)因此，乐观的科学家认为，基因组研究将彻底导致生物学革命。是基因组研究把生物学变成真正意义上的科学。也是因为这一估计，很多人认为，现在时期的基因组研究是千载难逢的机会。那个国家在现在的基因组研究中占有一席之地，那个国家就能在新生物学中青史流名。因此，毫无疑问，杨焕明教授等的贡献使中国成为6个测定人类基因组的国家之一，然后又独立完成水稻基因组测序。他们对中华民族的贡献是深远的。说他们是中华民族的英雄一点也不为过。

5)另一个重要的原因是，基因组研究将成为未来国家经济的基础。确实，测序只是其中的开端。但是用此做理由攻击基因组研究的人应该看到一个真理：没有这个开端是绝对要被未来抛弃的。在序列之后，还有功能，，，等等基因组研究。但这些是全新的方法。认为把传统生物学的作坊操作用上就解决问题是非常天真幼稚的。

6)由于基因组要在根基上革命传统生物学。很多传统生物学家有各种抵触情绪实在没什么奇怪。在几年前，一个象水稻基因组这样的结果，不知道能撤开发多少篇SCIENCE， NATURE， CELL。

6)我的胡乱猜想：生命可能是一种特殊的装置。他能把量子效应在宏观世界中显现出来。中国传统医学中的经络，可能就是生命复杂网络的一种深刻理论。