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拙劣的甩锅。
送交者: zhiyanle 2020年07月02日19:19:33 于 [教育学术] 发送悄悄话


中疾控官员的拙劣甩锅。
直言简评,2020-06-26。 网页链接

今日新闻介绍大陆官媒报道说,中国疾控中心26日在官网公布的文献提到,北京本次疫情流行的新冠病毒为L基因型欧洲家系分支Ⅰ,排除动物病毒外溢和武汉流行毒株导致的可能性。#

简评:中疾控官员试图【甩锅】甩给捷克,理由是其所谓【北京本次疫情流行的新冠病毒为L基因型欧洲家系分支Ⅰ】。那个甩锅做法很拙劣,其实进一步说明病毒病源就是中国大陆。

中疾控所谓L-基因之类说法的依据,是有人发现新冠病毒S-基因蛋白614位点发生D为G的变化,俗称【D614G】的变异或突变。根据这个变异,一些人把新冠病毒分为L-型和S-型;中疾控则将其划分为中国本土型和所谓【外来】【输入型】的【欧洲型】分支。

捷克官方说明,其首批确诊病号来自意大利旅游者,而意大利当局确诊的首批病号是来自中国的中国旅客,地点是意大利的拉兹奥(Lazio)。意大利当局采集提供的相关新冠病毒基因数据如下(摘录):

记录编号:GenBank: QKE43667.1。
采集地点:Italy: Lazio。
采集时间:2020-02-28"
基因序列:601 gtntsnqvav lyq
Gvnctev pvaihadqlt ptwrvystgs nvfqtragcl igaehvnnsy 。
数据来源:美国卫生部冠状病毒基因数据库。#

其中位点614为G。这说明,北京新波疫情的新冠病毒病源来自中国大陆;该S-蛋白基因的【D614G】的变异或突变,发生在中国大陆;中国旅客把该病毒带到了意大利。

那不是唯一的发生在中国本土的新冠病毒S-蛋白基因变异。譬如,武汉病毒所2019年12月30日采集的病号病毒基因序列WIV07、中疾控安徽中心2020年02月15日采集的病号病毒序列CHN/MAS525,两者S-基因相似度就不是100%而是99%;时间间隔大约50天,S-基因就发生了变异,譬如T455A的变异(S-蛋白的基因位点455的T变异为A。注意,是S-蛋白的基因序列变异)。如下(摘录):

S-基因比对(长度3819)相似度:3818/3819 (99%)。
Query 421 CTGGGCGTGTACTACCACAAGAACAACAAGAGC
TGGATGGAGAGCGAGTTCAGGGTGTAC
Sbjct 421 CTGGGCGTGTACTACCACAAGAACAACAAGAGC
AGGATGGAGAGCGAGTTCAGGGTGTAC
其中:Query:WIV07(武汉病毒所采集提供),Sbjct:CHN/MAS525(中疾控安徽CDC采集提供)。数据及方法:美国卫生部冠状病毒基因数据库,BLAST。#

可中国和国际学界并没因此把新冠病毒划分为【武汉型】和【安徽型】两个类型分支。就【D614G】,同样,国际官方和学界也没因此变异而把新冠病毒做【欧洲型】的类别划分(个人如何划分是另一回事)。在美国卫生部病毒基因库的关系树那里,即便是来自中国的或来自欧洲的病毒基因序列,分支也是按照整个基因序列的关系相似度排列的,不是仅仅根据一个蛋白或一个基因的变异而排列的。其实,国际学界多数人(包括中国学者)并不认为那个分类有啥意义(即该分类不成立):冠状病毒的S-基因与动物受体ACE2彼此互动、过程中两者都可能发生变异,但已发现的变异或突变并没改变冠状病毒S-基因的形态功能而使之可以做上述类型划分。发生多个基因蛋白位点都是如此了,那么,只发生一个位点变异就更是没有那种类型划分的意义。

简言之,不管中疾控官员怎么绕弯子搞甩锅,事实证明北京本次新波疫情的病毒来自中国本土。


参考阅读:

报道:捷克首批确诊病号是来自意大利的旅客。
Czech health minister confirms first 3 coronavirus cases.
MARCH 1, 2020
https://medicalxpress.com/news/2020-03-czech-health-minister-coronavirus-cases.html

报道:意大利首批确诊病号为来自中国的中国旅客。
Coronavirus, first two cases in Italy "Two Chinese people are on vacation in Rome" They arrived in Milan on 23 January.
https://www.corriere.it/cronache/20_gennaio_30/coronavirus-italia-corona-9d6dc436-4343-11ea-bdc8-faf1f56f19b7.shtml


调查论文:意大利首批确诊病号为中国旅客一对夫妇,在意大利拉兹奥住院(基因样本采集地)。
A doubt of multiple introduction of SARS-CoV-2 in Italy: A preliminary overview.
Journal of Medical Virology • March 2020
https://www.researchgate.net/publication/340032561_A_doubt_of_multiple_introduction_of_SARS-CoV-2_in_Italy_A_preliminary_overview 
The COVID-19 outbreak started officially in China in January 2020, although the virus was probably already circulating in the country since late October 2019 according to a recent report (Giovanetti et al. 2020). In Italy the first infected patient was officially detected on the night of February 20 in Codogno (Lombardia),
but a couple of Chinese tourists was hospitalized in Rome (Lazio) already at the end of January after the confirmation test of the infection. ..

美国当局防疫中心转发意大利文章:新冠病毒S-基因蛋白D614G变异来自意大利拉兹奥病例。
SARS-CoV-2 Phylogenetic Analysis, Lazio Region, Italy, February–March 2020.
Barbara Bartolini, .... Author affiliations: National Institute for Infectious Diseases “Lazzaro Spallanzani” IRCCS, Rome, Italy.
Volume 26, Number 8—August 2020
https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/26/8/20-1525_article 
Abstract: We report phylogenetic and mutational analysis of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 virus strains from the
Lazio region of Italy and provide information about the dynamics of virus spread. Data suggest effective containment of clade V strains, but subsequently, multiple waves of clade G strains were circulating widely in Europe.

不说国际学界,就中国自己的学者也认为中疾控和中科院的L/S类型分类不成立:
《新冠病毒已突变?专家:变化极小,不说明任何问题》。
2020-03-05 09:57:48新京报 记者:张胜坡 编辑:王婧祎。
http://www.bjnews.com.cn/feature/2020/03/05/699253.html 
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  共匪五毛狗,你这地痞流氓,就傻逼一个  /无内容 - 谁胜负 07/19/20 (139)
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