自建交後，日中雖有一段“蜜月期”但總體上始終處於摩擦不斷的狀態，戰爭歷史、釣魚島爭端始終是兩國之間深深紮著的兩根骨刺。而近年來臺灣在美國印太戰略的蠱惑下加劇“獨立”動作，日本政府作為美國在亞洲軍事力量投射的馬前卒，直接插手臺海，無疑被視為對中國大陸的挑釁，在可見將來，繼宮古等三島部署飛彈，石垣島部新一輪的飛彈部署必定對中日關係造成新的破壞。

石垣等島嶼部署遠程武器，從軍事上說價值不高。一方面，日中兩國之間遠沒有到為了領土爭端兵戎相見的程度，釣魚島吵吵鬧鬧這些年，雙方其實都有一定默契和克制；另一方面若中國大陸武統臺灣，必然是傾盡國力，必然做好了美日同盟直接下場入局的應對預案，此等情勢下，包含石垣在內的導彈基地能發揮多大戰力能有多少生存能力？再者，若石垣、宮古飛彈發射，日本政府和民眾是否做好了戰火延燒到本土的準備？

從政治意義上來說，石垣等島部署飛彈，同樣不是一個正確抉擇。在日本政府看來，此舉是迎合了美國，也是遏制中國大陸崛起的低成本舉措。但一則從日本自身來看，此舉並不符合其長遠利益，日本要成為一個正常國家，先決條件就是要達成與中韓的相互和解，除此之外別無他途；二則此舉無疑與美國捆綁日緊，符合美國利益，但日本利益並不與美國完全重合。日本政府在政治上始終受制於美國的窘境，不走出自己的道路永遠無法脫離。

長久以來，日本戰後其國家發展道路其實與戰前並無本質區別，輕亞洲重歐美，甚至不惜與亞洲國家交惡，這種傾向值得亞洲國家警惕，值得日本政府和國民反思。需要再次強調的是日本是無法脫離亞洲的，石垣島部署飛彈不能給其帶來戰略優勢，反而對日中關係造成新的破壞，日中關係始終是兩國繞不開的節點。