外蒙正式脱离中国是在1946年，那一年，国民政府正式承认外蒙是一个主权独立的国家。而外蒙开始策划独立则要追溯到清朝末期。
密谋独立
日俄战争以后，沙俄就将蒙古作为他的势力范围，与蒙古交往甚密，蒙古上层贵族开始产生亲俄思想。宣统三年7月10日，以库伦活佛为首的外蒙古僧俗封建主，在库伦郊外召开四盟王公秘密会议，决议外蒙古“独立”，并派人秘密出访圣彼得堡请求俄国政府“庇护”。
面对送上门的领土，尼古拉二世自然是非常高兴。辛亥革命后，清政府在全国的统治逐渐瓦解，蒙古贵族趁这个机会联合沙俄解除了蒙古的清军武装，12月29日，博克多格根在库伦登基，成为了所谓大蒙古国“神圣皇帝’”，史称“博克多汗国”，后自称“日光皇帝”。
蒙古叛军联合沙俄军队逐步扫荡境内的清军，大清乌里雅苏台将军连同700多清军被俘，押送出境，蒙古获得事实上的独立。
中华民国成立后，不承认所谓“蒙古独立”，由于国内一团混战，北洋政府无力北顾，只能是不停和沙俄交涉，而沙俄也怕明目张胆吞并蒙古引起国际干涉，经过艰苦谈判，中国以不在外蒙驻兵、殖民、设官，承认外蒙自治，承认《俄蒙协约》及其专条，换回俄国承认中国在外蒙的宗主权，基于宗主权而衍生出俄国承认外蒙古为中国领土一部分。
徐树铮和外蒙古贵族合影
中国对蒙权力已由主权沦为宗主权。直到1915年，中、俄、蒙三方签订密约，蒙古撤销独立，改为在中国境内自治，大总统袁世凯册封八世哲布尊丹巴为“呼图克图汗”。
1917年沙俄爆发十月革命，红白双方的斗争也蔓延到了蒙古，蒙古上层贵族害怕所谓“赤潮”，于是给北京发电，请求派兵保护。1919年6月，沙俄白军谢苗诺夫率兵武力进犯外蒙古，导致外蒙古王公恐慌加剧，再次请求北洋政府派大军进入外蒙古对其进行保护。
白俄哥萨克骑兵
北洋政府的考虑也很有意思，段祺瑞政府命令徐树铮火速率军前往外蒙，主持撤治之事，以夺陈毅之为己功，重振皖系的政治声望。北洋将领徐树铮率西北边防军第一师进入外蒙古。在11月17日，徐树铮撤销了外蒙自治，将外蒙古置于北洋政府的直接管辖之下。
此时沙俄内忧外患，根本无暇南顾，实在是解决蒙古问题的大好时机，事实上形势也是一片大好。同年11月17日，外蒙古正式上书中华民国大总统徐世昌，呈请废除俄蒙一切条约；南方孙中山护法军政府亦致电庆贺。
11月22日，徐世昌“俯如所请，以顺蒙情”，以《中华民国大总统公告》下令取消外蒙古自治，恢复旧制；同时取消《中俄声明》和《恰克图协定》，北京政府在库伦设立“中华民国西北筹边使公署”，由徐树铮部（西北边防军）在库伦、科布多等地驻防，并派兵收复唐努乌梁海。
库伦战败
但这时，变数出现了，这个变数就是白俄男爵罗曼·冯·恩琴。到了1920年，由于中国国内仍然在军阀混战，收复外蒙的徐树铮率兵回国， 在库伦只留下了少量兵力，具体有多少呢？
身穿蒙古传统服饰的罗曼·冯·恩琴
中外记载互相歧义，众说纷纭，前苏联学者兹拉特金说在蒙古的中国军队有1.2万人，卸任乌里雅苏台专员的孟榘回忆说库伦的中国驻军有8000人，其中褚祺祥的步兵旅5000人，高在田的骑兵团1200人，而当时也在库伦的李恒则说中国驻军兵不过4000。根据后续的战斗记录，李恒的说法较为可靠，中国在蒙古的驻军不到两个步兵旅。
1920年10月26日，已经在蒙古当地召集了千余部众的恩琴联合蒙古哲布尊丹巴集团的叛军共5000人向库伦的中国守军发动进攻。一帮乌合之众，前两次进攻都被打退，于是恩琴开始采取围困战术。他们盘踞在库伦周边烧杀抢掠，裹挟蒙古百姓参军或传递情报，或偷袭中国军队。
到1921年1月下旬，库伦已经三面被围，很明显，恩琴想让中国军队主动弃城南逃，库伦的中国孤军坚守三个月来，已经弹尽粮绝，南边的粮道早就被断绝，北京的援助遥遥无期，冻死冻伤者甚多，士兵丧失斗志，整个城市弥漫着绝望。
中国军队在库伦最后坚守的建筑
1921年2月1日，恩琴指挥叛军从东部发动猛烈进攻，并派1000余人同时从南面发动进攻，一队300人的叛军攻破城门歼灭中国军队护卫哲布尊丹巴的两个连，将之劫出城外。恩琴利用哲布尊丹巴号召蒙古人，叛军士气大增。
2月2日拂晓，叛军再次对中国军队发动猛攻，褚祺祥部队全线败退，高在田率部逃跑，镇抚使陈毅乘坐汽车逃跑，当地汉族商民随之南逃。上午九点，恩琴匪军占领库伦，派兵继续追击中国军队。
恩琴进城后，对没来得及逃跑的汉人进行大肆屠杀，同时遇害的还有苏俄支持者。自此中国军队被迫从蒙古撤退，再也没踏入这块祖宗之地。
太上皇结局
不过恩琴毕竟是白俄，是苏俄红军的死敌，因此苏俄红军肯定不可能坐视他在外蒙古坐大，因此在恩琴的军队入侵外蒙古前后，苏俄军队以及受到苏俄支持的蒙古人民军也开始在外蒙古境内与其作战。
恩琴被处死前的留影
在当了不到半年的蒙古太上皇后，1921年7月6日，苏蒙军队攻占库伦，恩琴被迫出逃。8月20日，恩琴被苏俄红军俘虏，9月15日，恩琴被判处死刑并被处死。
