人類基因組測序計划進行了29年，顛覆了之前古人類學的人類多地起源模型，從現存人類追溯到非洲6萬至20萬年前的智人。非洲智人的一部分在4.5萬至6萬年前走出非洲，遷徙到世界各地。

智人出非洲時，全球還在末次冰期中。末次冰期是第四紀的更新世內發生的最近一次冰期。末次冰期約於11萬年前開始，於公元前9600-9700年完結。這段期間曾出現數次的冰進及冰退。冰退稱為間冰段。格陵蘭的冰芯鑽探表明，過去十萬年的末次冰期共有24個間冰段。末次冰期的最盛期發生於約1.8萬年前。一般而言，全球冷卻及冰川前進的模式相似，但也有局部的分野，因而很難以大洲來比較。

在末次冰期，海平面下降，最多時海平面比現在下降120米。大陸和島嶼周邊有很大面積的冰層，河流也往往結凍。有些大陸之間、與島嶼之間、島嶼之間因海平面下降連接起來或被冰層連接起來。例如：東南亞（緬甸、印度支那半島、海南島、馬來半島與巽他群島的蘇門答臘島、爪哇島、加里曼丹島、菲律賓群島的一些島等）露出水面並連成一體的陸地，是巽他古陸（Sundaland）；而澳大利亞、新幾內亞和塔斯馬尼亞，合為一體，稱為薩胡爾古陸（Sahulland）。如下圖所示：

美國伊利諾伊大學的斯坦萊·安布魯斯（Stanley Ambrose）提出多峇巨災理論：7萬至7.5萬年前在印尼多峇湖發生一次大規模的火山爆發。這火山爆發強度為8級，即超大規模級數。釋放的能量達到10億噸烈性炸藥量，或為1980年聖海倫火山爆發的3000倍。大量的火山灰令全球溫度在之後數年間下降了3至3.5攝氏度，引起一次冰進時期，使那時的世界人口大為減少。

此後氣候寒冷而乾旱，而大海可以緩解下降的氣溫和乾燥的空氣，海貝等食物又容易獲取，非洲智人群體在印度洋東非海岸線生存。

在4.5萬至6萬年前的某段時間，海平面較低，在紅海的曼德海峽（今非洲吉布提與亞洲也門之間），海冰連接了東非和阿拉伯半島。一群非洲智人（帶有Y染色體單倍群CT）為了追逐食物，不經意地踏上了歐亞大陸。

這個群體繼續向前沿着印度洋的海岸線遷徙，不久就就到達了印度河河谷。這個河谷以及南亞次大陸是遷徙者遇到的氣溫和濕度最高因而植被最茂盛的地方，如下面的末次冰期的陸地植被圖所示：



因為自然環境好，他們在此停留，後代分化出CF人群和DE部分人群。CF人群的部分後代的Y染色體單倍群的突變經歷了：

F——K——MNOPS——P

P的子群R1a人群形成印度-伊朗人。其中部分人向北遷徙到中亞，形成南中亞突厥人，他們是中國西北突厥人的祖先。

P人群的一部分向東北遷徙到西西伯利亞的葉尼塞河流域，形成葉尼塞-塞爾庫普人，帶有Q標記。

以上遷徙，可以參看世界Y-染色體單倍群地圖：

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/c/ca/World_Map_of_Y-DNA_Haplogroups.png

葉尼塞-塞爾庫普人可能是部落聯盟匈奴人的領導部落。近年新疆哈密地區巴里坤-黑溝梁墓地的發掘, 被認為是漢代匈奴夏季王庭所在地, 墓地人類遺骸檢測出全是Q類型: Q1a*, Q1b, Q*。 後來的研究表明，還存在幾例Q-M3, 即印第安人的主要類型之一。也是在匈奴影響區域, 寧夏彭陽縣出土東周時期古墓, 遺骸檢測出全是Q1a1類型。墓葬中有青銅劍，春秋戰國只有貴族才能佩劍。山西絳縣橫水村2004年發現西周墓地, 失落3000年的倗國橫空出世, 不見於史籍記載, 也許在商時已經存在。其葬俗有相當大的非周人傳統,古DNA證明Q1a1是當時貴族血統。

蒙古北部額金河和東北部Duurlig Nars發現2000年前的匈奴古墓，根據對古墓中的DNA檢測，基因類似目前北亞蒙古人種, 還有一例是R1a1。

此外，曲阜孔子後裔有近三分之一是Q人群後裔。孔子自稱是殷人。最近，研究人員對曲阜地區1118名孔姓男性進行DNA檢測，發現有3種高頻單倍群：C3（古通古斯人、部分古蒙古人、古哈薩克人）為46%，Q1a1為27%，O3（古漢藏人和古苗瑤人）為20。雖然O3是通常漢族單倍型，前兩者有着明顯的單祖先擴散結構，最可能是孔子類型，當然要假設孔子的後代仍然在曲阜地區。是這樣嗎？請看幾個歷史事件。

1. 孔末亂孔： 孔末是一個雜役，按當時仆隨主姓的習俗姓孔, 在五代十國時期，眼見天下大亂，時局動盪，起了謀逆奪位的野心，大殺孔子後裔及四十二世孫孔光嗣，儼然以孔子嫡裔自居。他的後代世稱「外孔」。

2. 孔仁玉中興： 聽說孔光嗣的獨生子孔仁玉剛滿九月，被母親張氏抱回娘家撫養成人。在後唐明宗長興元年，魯人將孔末告之於官府, 孔末被殺, 孔仁玉恢復嫡裔，但他也有可能是張氏的長子。他的後代世稱「內孔」。

3. 元朝滅南宋後，欲召南宗孔氏回曲阜襲封奉祀，孔洙辭讓，蒙古人另冊封一個北宗“衍聖公”, 於是山東曲阜的孔府就這麼傳下來了。
印度河谷的CF人群，除了分化出F人群，還分化出C人群，再突變為C5。C5在今南亞（巴基斯坦、印度和尼泊爾）低頻分布（一般在5%以下），只有在印度北方邦江布爾縣的第四等種姓首陀羅（農民，從事農業和手工業）中占28.6%。

印度河谷的C人群，部分繼續沿海岸線遷徙，在本州島和北海道折向內陸。分化出C1和C3，與D2形成阿伊努人（繩文人）。部分C3人群繼續向西北內陸遷徙，部分人在黑龍江上游向西南遷徙，到達蒙古，形成蒙古人。在西伯利亞和蒙古的C3人群分化出C3c和C3d，C3c人群形成通古斯人。部分C3c人向西遷徙，到達中亞，形成哈薩克人。

繼續沿海岸線遷徙的DE人群有突變D，到達巽他古陸（今東南亞）時分為三撥。第一撥向南登上孟加拉灣的安達曼群島，在此生息至今。第二撥折向北面的伊落瓦底江河谷，沿江向東北上行進入東亞，最遠到達青藏高原。分化出D1和D3，形成藏緬人。第三撥繼續沿海岸線遷徙，在本州島和北海道折向內陸，參與形成阿伊努人。

印度河谷的MNOPS人群分化出NO人群，繼續沿海岸線遷徙，在巽他古陸停留，分化出N人群和O人群。

N人群繼續沿海岸線遷徙，在海南島折向內陸。東亞大陸上N低頻分布（2%至10%），但是珞巴族中有35%，彝族中有30%。N人群向北方內陸遷徙，到達西南西伯利亞，有突變N1——N1c，形成南西伯利亞突厥人。部分N1人群向西遷移到中亞，有突變N1a，融入哈薩克人。

O人群分化出O1、O2和O3。

O1人群繼續沿海岸線遷徙，在閩粵停留，形成壯傣人。現代壯傣人中大多是O2a，是因為南亞人大量融入。海南變為島嶼後相對封閉，黎族的O1為26%。台灣變為島嶼後，因離大陸遠而封閉，壯傣人形成南島人，都是O1。部分南島人再渡海遷徙到東南亞的菲律賓、加里曼丹島北部、蘇拉威西島和東非的馬達加斯加島。

O2人群分布在巽他古陸東部，分化出O2*、O2a和O2b。

O2*人群向北遷徙到東亞，在現代苗瑤人中分布最多，在瑤族中有高頻分布。

O2a人群形成東巽他人（今爪哇島和加里曼丹島南部）和南亞人（今印度支那半島）。曹操及其今日後裔是O2a。

O2b人群繼續沿海岸線遷徙，在本州島停留，與朝鮮半島遷入的O3-M134（漢藏人）一起形成韓日人（彌生人）。

O3人群形成西巽他人（今蘇門答臘島和馬來半島）。部分O3人群沿着伊洛瓦底江北上，到達長江上游，分化出O3-M7和O3-M134。

O3-M7人群沿着長江東下，形成苗瑤人。

O3-M134人群繼續北上，形成漢藏人。