中國的基因組學從人員、設備、成果都已經走進世界前列，不可半途而廢。以以下經文勉勵：
路加福音
14:28 你們哪一個要蓋一座樓，不先坐下算計花費，能蓋成不能呢？
14:29 恐怕安了地基，不能成功，看見的人都笑話他，
14:30 說：‘這個人開了工，卻不能完工。’
14:31 或是一個王出去和別的王打仗，豈不先坐下酌量，能用一萬兵去敵那領二萬兵來攻打他的嗎？
14:32 若是不能，就趁敵人還遠的時候，派使者去求和息的條款。
詩篇
127:1若不是耶和華建造房屋，建造的人就枉然勞力；若不是耶和華看守城池，看守的人就枉然警醒。
願神祝福中國的基因組研究，阿們！
“基因組就是一個物種所有基因的總和；
解:這是很好的定義和理解,包括了胞質基因組;
人類基因組就是人類所有基因的總和”。
解: 將未來的應用做了潛在的表述,強調了人類基因組的多態性.建議白字秀才無須自扁不懂的就多學習有錯就改.
解：通過他們的努力一個一個地做下去有什麼不好? 你心疼什麼?別人申請不到課題和他們一個一個地測下去沒有關係.你稱我為弟兄,我再和你分享有段經文吧.
路加福音:
19:12 “有一個貴胄往遠方去，要得國回來，
19:13 便叫了他的十個僕人來，交給他們十錠（註：“錠”原文作“彌拿”，一彌拿約銀十兩）銀子，說：‘你們去做生意，直等我回來。’
19:14 他本國的人卻恨他，打發使者隨後去，說：‘我們不願意這個人作我們的王。’
19:15 他既得國回來，就吩咐叫那領銀子的僕人來，要知道他們做生意賺了多少。
19:16 頭一個上來，說：‘主啊，你的一錠銀子已經賺了十錠。’
19:17 主人說：‘好！良善的僕人，你既在最小的事上有忠心，可以有權柄管十座城。’
19:18 第二個來，說：‘主啊，你的一錠銀子已經賺了五錠。’
19:19 主人說：‘你也可以管五座城。’
19:20 又有一個來說：‘主啊，看哪，你的一錠銀子在這裡，我把它包在手巾里存著。
19:21 我原是怕你，因為你是嚴厲的人：沒有放下的，還要去拿；沒有種下的，還要去收。’
19:22 主人對他說：‘你這惡僕，我要憑你的口定你的罪！你既知道我是嚴厲的人，沒有放下的，還要去拿，沒有種下的通過他們的努力一個一個地做下去有什麼不好?，還要去收，
19:23 為甚麼不把我的銀子交給銀行，等我來的時候，連本帶利都可以要回來呢？’
19:24 就對旁邊站著的人說：‘奪過他這一錠來，給那有十錠的。’
19:25 他們說：‘主啊，他已經有十錠了。’
19:26 主人說：‘我告訴你們：凡有的，還要加給他；沒有的，連他所有的也要奪過來。
19:27 至於我那些仇敵，不要我作他們王的，把他們拉來，在我面前殺了吧！’”
解：你的解釋看的出你是一個好中學老師.謝.請問:"這個生物體在單倍體狀況下所有遺傳信息的總和”你說的單倍體由多少個細胞組成?是構成所有單倍體的細胞的遺傳信息的總和還是一個細胞單倍體的細胞的遺傳信息的總和?告所你吧,中央廣播電台的記者不是在做學術報告.他的話內行一聽就知道是怎麼會事,強調的是一個細胞(體細胞)染色體的一半加線粒體等胞質基因組及基因多態信.她這末說和記者的素質有什麼關係?我敢肯定他請教了專家.
你給我的印象就是方舟子的翻版.
願你自重!自扁不等于謙虛也不等於自重.
白字秀才：既然你那麼謙虛，我也就當回“老師”。你說你相信於軍和楊煥明。我不知道於軍他們是如何定義基因組的，從你的口氣，他們也是認為“一個物種的基因組是一個物種的所有基因的總和”。如果他們是這樣告訴你和你的那個記者朋友的話，那麼我告訴你，他們錯了。
基因組，英文是genome，不管是從英文還是中文，一個生物體的”基因組“的定義是“這個生物體在單倍體狀況下所有遺傳信息的總和”。
請不要把“遺傳信息”想當然地等同於“基因”！
一個生物體所有遺傳信息總和是指這個生物體裡面DNA分子鹼基對的數目。
所以，講道人的基因組大小的時候，總是說有大約30億個鹼基對。
比如你轉的貼子裡面胡松年在說道水稻的基因組的時候，說“秈稻基因組共包含 4.66億個鹼基對”，而不是說“秈稻基因組共包含4.6至5.6個基因”。
人類的基因組裡面大約含有2.5到3萬個基因，真正的遺傳專家不會說“人類基因組的大小是2.5至3萬個基因”，只會說“人類基因組裡面包含2.5到3萬個基因”。
因為，這2.5到3萬個基因只占人類基因組的很小一部分，大約5%左右，也就是說，人類基因組30億個鹼基當中，有95%的DNA是不編碼基因的。
如果說基因組就是基因的總和的話，那麼那些不編碼基因的95%DNA順序就不屬於人類基因組的部分了嗎？
同樣，秈稻基因組裡面的4.6萬至5.6萬個基因所占整個基因組的很小的一部分，所以，秈稻的基因組的大小是4.66億個鹼基對，而不是4.6萬至5.6萬個基因。
所以，談到“基因組”這個詞的時候，是指生物體“遺傳信息的總和”；“遺傳信息”是指“DNA分子鹼基對順序”；“基因”是指“能被轉錄或翻譯為蛋白質的一段DNA鹼基順序”。在基因組裡面，絕大部分的DNA鹼基對順序是不被轉錄或翻譯為蛋白質的。
請你轉告你的記者同事，以後說基因組之前，不要再想當然。雖然看起來很有道理，通俗易懂。
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這份覆蓋92%水稻基因組的草圖發現，秈稻基因組共包含 4.66億個鹼基對，基因數量在4.6萬至5.6萬之間。
白字秀才：另外請你告訴於軍他們。於軍回憶說，“中國人的主食是水稻和小麥，還有豬肉，相比下來哺乳動物的基因數量要比植物大得多，“
就在同一個帖子裡面，胡松年說”水稻的基因數目在4.5至5.6萬個之間“，而人
的基因總數在哺乳動物應該是最高的了，大約只有2.5至3萬之間。
”2.5至3萬之間“如何要比”4.5至5.6萬之間“大得多？
事實上，有不少植物的基因組要比人類的基因組大。如果於軍他們預測的水稻基
因數量不錯的，水稻的基因數目也明顯比人類的基因數目大。
更重要的是，從帖子看，於軍他們想一個物種一個物種的測下去，而且測下去的
目的是為了讓他們那個”華大“能拉到錢，生存下來。
請轉告他們，他們的”方向錯了“。
當把人類30億個鹼基的基因組測出來的時候，後面還有許多的問題，也就是如何
分析這龐大的遺傳信息，從中發現對人類疾病預防有用的東西。
所以，華大完全可以在‘快速，便宜地測人類基因組”上下功夫，如果他們能發
展一種技術，幾個小時，或一天就能測出一個人的基因組的話，市場的前景是非
常大的，未來人類的醫療完全會根據每個人的不同基因組的情況而定。這就需要
“快速及時”地測個人基因組順序的技術。
那種一個個物種的測法，除了對他們生存有更大的意義，不能說沒有科學意義，
但挑戰性大大降低。
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大陸的記者急需加強專業道德和職業素質
送交者: 白字秀才 2005年4月24日21:30:31 於 [教育與學術]http://www.bbsland.com
今天聽中央台的一個新聞節目，一位中央台的記者妹妹現場介紹正在中國召開的人類基因組周活動。
只聽這位記者說“基因組就是一個物種所有基因的總和；人類基因組就是人類所有基因的總和”。
堂堂一個國家級的電台，它的記者怎麼能就這個水平？當碰到不懂得專業問題時，不能認真學習請教別人，自己搞明白了再向廣大聽眾介紹不好嗎？
在西方的一些重要媒體中，如果講到某些專業知識時，你往往會吃驚地發現這些記者的專業知識水平非常高。
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感謝讚美神：他們蒙了祝福，阿們！
送交者: 解構函數 2005年4月23日13:44:32 於 [教育與學術]http://www.bbsland.com
水稻基因：7000萬債務的輝煌（ZT）
記者：李偉 巫昂
胡松年告訴記者，有很多作家找到華大，想把他們的故事寫成小說和電視劇本，就像徐遲寫陳景潤一樣。但基礎研究並沒有那麼浪漫，華大的生存依舊艱辛。4月 5日《科學》雜誌用14頁篇幅來發表《水稻基因組序列草圖》的論文，這是中國科學家獨立完成植物測序工作。華大基因研究中心是該研究的主力，也是榮譽的獲得者，但它同時也是7000萬元債務的
承擔者
“華大是個怪物”
杭州西湖邊著名景點“曲苑風荷”邊有一座靜謐的小院，“華大基因研究中心杭州中心、中國科學院人類基因組生物信息中心南方基地”就坐落在這裡。
4月11日胡松年博士在接受本刊記者採訪時說，“我們的身份是雙重的，華大是一家非盈利的民營公司，而中科院則代表政府機構。參與商業性較強的項目時華大寫在前面，後面是‘暨中科院基因組生物信息中心’，如果公益性強，則把‘暨’的兩端做一個翻轉。”胡松年是華大基因杭州中心主任，今年33歲。華大成立了4年。“華大是個怪物，但它做了很多事情，國外學界會把功績籠統記在中國科學家名上，但他們很可能不知道華大。”華大的4位創始人之一，現任副總於軍對記者說。於軍1955年出生，80年代初留學美國，即從事人類基因組的物理圖研究，是華盛頓大學基因組中心的創始人和運作人之一，是人類基因組計劃中第一位舉足輕重的華人。
一個星期之前的北京科學會堂，美國《科學》雜誌主編魯賓斯坦專程來中國召開新聞發布會，他的興奮在於“中國科學家為解決世界飢餓問題向前邁了一大步”。於軍與胡松年是《水稻基因組序列草圖》論文的第一、第二作者。這份覆蓋92%水稻基因組的草圖發現，秈稻基因組共包含 4.66億個鹼基對，基因數量在4.6萬至5.6萬之間。水稻這種禾本科植物養活了世界一半以上人口，它天書般的秘密終於被揭開了第一層面紗。
論文有一個近百人的作者名單，其中四位主要作者是:於軍、胡松年、王俊、王剛，除了王剛是加拿大科學家外，前三位都來自華大基因研究中心。事實上，華大的北京中心和杭州中心承擔了這次測序的絕大部分工作。他們把最終成果數據庫放在自己的網站和美國國家生物技術信息中心(NCBI)的網站上免費下載。數據公布後一個月多月里，總共接受了1萬多次訪問，有550次下載，但來自國內的訪問卻少得可憐，只有50多次，其中大部分還是浙江大學內部的。“我們是做基礎研究的，但現在還要去推動應用發展，國內很多企業和研究所對它能做什麼還不清楚。”胡松年說，“而美國有60%的種子都來自分子育種。”4月初華大基因杭州中心和浙江大學搞了一個培訓班，講授水稻基因組草圖的應用方向與可能性，總共有40多人參加。
“為1%而生，為水稻而死”
水稻項目成功後，華大的人都鬆了一口氣，拋開科學的意義不談，水稻項目之於華大更像汪洋中的一塊木板，生死存亡繫於一線。“水稻如果不做，或做砸了，華大就得解散，”胡松年說得很坦然。
2000年的春天，以華大為主承擔的人類基因組計劃的1%測序任務已接近尾聲，草圖基本完成，而下一步要做什麼還未可知。1998年，楊煥明、汪健、於軍、劉思齊為承接1%測序任務，在體制外創立了華大，當使命行將結束時，華大對未來不得不重新考慮。“當時我們有十幾台測序儀，處境比較尷尬，麻省的聖路易研究中心有一百多台，賽來拉公司更是有幾百台。華大要獲得新的發展，必須藉助新的項目。”胡松年說。那年春天，華大的幾位決策人都比較焦慮， “生物研究有兩樣東西價值最大，一個是人本身和疾病的研究;另一項就是食物，糧食或是食用動物。”於軍回憶說，“中國人的主食是水稻和小麥，還有豬肉，相比下來哺乳動物的基因數量要比植物大得多，而小麥要比水稻複雜得多。我們選擇了比較容易而且也是入門項目的水稻，水稻成功了，可以滲入到小麥和玉米。”當時惟一的一個有利條件是，袁隆平雜交成功的超級水稻，它的父本是純種秈稻;水稻有兩大亞種，一個是高緯度的粳稻，另一種是低緯度的秈稻，“從雜交的最終結果上，秈稻的產量是更是無法比擬的，這為我們明確了研究對象——純種秈稻。”於軍說。
事實上外在環境更為嚴峻。美國的孟山都公司已經在 2000年4月宣布完成了水稻基因組的框架圖，只是沒有公開數據;瑞士與美國的合資公司先正達 (Syngenta)、日本科學家牽頭的公益組織——“國際水稻協作組”也早已開始了工作。所不同的是上述三家的研究對象是粳稻而不是秈稻，“儘管如此，在科學競爭上的基本規則是只有第一，沒有第二。特別是如果日本的‘國際水稻細作組’的數據公開後，我們就失敗了，再怎麼努力價值也不大。”胡松年說。
華大的第一個項目是研究噬熱菌，接下來就申請到了1%任務，而且得到國家立項，拿到7000萬元的經費。華大的一位負責人接受採訪時曾說，“噬熱菌是個幌子，做了它我們就可能拿到1%;而後來1%也是個幌子，為了我們做水稻、豬和家禽。將來華大最終是要做中國人自己的測序和多態性研究。”這一個接一個的幌子為華大帶來了名氣和資金;華大要生存，也只有依靠這些“幌子”一次次艱難地證明自己。
華大的副總汪健在內部會議上幾次半開玩笑地說，華大“生於1%，而死於水稻”。
財務困境
回到2000年5月11日，在北京空港工業區的華大總部，國家雜交水稻研究中心、華大基因研究中心、中科院生物信息中心簽署了協議，共同啟動 “中國超級雜交水稻基因組計劃”。三方代表人分別是袁隆平、楊煥明和朱立煌。袁隆平提供上游水稻的育種、育苗和相關背景知識，楊煥明的華大做測序，當時遺傳所副所長朱立煌主持後期應用性開發。華大與水稻所、遺傳所的協定也只是簡單的君子協定，講明合作而沒有資金往來，同時只是說將來的成果共享，並沒有達成決議是否向世界公開數據。“這裡面的一個主要原因，是由於經費沒有落實，不知道將來誰買單，因而成果的處置也沒法說定。”胡松年說。這時水稻研究的賬上還只有科學院撥付的資金500萬元人民幣啟動資金，而華大對項目的預算卻已達到2000萬美元。
據胡松年介紹，水稻基因組測序的全面展開是在 2001年7月，此間的一年零兩個月華大忙於各種準備工作。他們先後採購了60台Megabace 毛細管測序儀，每台價值250萬元，自己編制組裝基因計算機軟件，引進曙光3000和Sun10000大型計算機機組，選苗育種也相繼展開。而最重要的就是去找錢。
找錢的路徑和“1%項目”如出一轍——希望政府立項提供資金支持。胡松年至今還保留着很多申請報告，分別投向自然科學基金會、科技部、農業部以及各地政府。“973”、“863”都申請了，論證會也開了一場又一場，但始終沒有決議。主要原因還是風險大而近期看不到效益。而最終獲得科技部的立項是在2001年9月中旬，一個星期後，華大的測序工作已基本完成。
2001年5月，日本牽頭的“國際水稻協作組織”宣布年底將完成水稻基因組草圖;這個外在刺激使華大無法再等待。好在浙江省和杭州市政府分別為華大提供了5000萬元3年期貼息貸款和1000萬元1年期貼息貸款。 2000年華大與丹麥政府簽署了家豬基因研究計劃，2001年第一筆資金400萬美元也到位了，同年7月測序工作全面啟動。“我們挪用了大部分家豬計劃的款項，應該說是違規操作吧，但就是沒錢也得干。”華大的一位負責人說。
錢就這麼多，不夠只能想盡辦法降低成本。胡松年說華大的生產方式是“半自動化”，很多設備都沒有買，活都是人幹的，“我專門算過賬，用20個人，一個月工資不過兩三萬元，但效率頂得上三四台機器”。為了水稻測序，高峰時華大總共投入160人，而國際上一般只需要20個人左右。另一個節約大頭是使用國產試驗材料。“我們把國外的材料拿來，交給國內廠商做模具能便宜8～10 倍。”胡松年說。華大用的“槍頭”是1分錢1個，在國外要1毛錢;“96孔板”是2塊錢，市價是4～5元，而進口的則要40多元。在國外每個“毛細管”一般只用100次，多了就會影響精度。但廠商在設計時還是留有餘地的，在這個狹小的“餘地”里華大盡其所能地周旋，平均每根用到了500次，一根“功勳管” 竟達到800次。整個測序期間，華大還搞了70多項優化，一個計算上的小參數的改變就能節省上萬元。按華大內部的說法，在成本上華大與國際研究機構的距離是一個匯率——也就是說做同樣的事，華大用一元人民幣，而其他機構則要用一美元。
2001年8月測序進入了高潮，華大決策層下了死命令，所有工作一定要在10月1日前完成。胡松年手中有一個工作進度圖，按原來的進度曲線要到年底才能完成，而現在即使全力以赴也要看運氣，“這個測序有8道工藝， 8個組不能有任何差錯和意外。”整個機構開始了瘋狂工作，平時一台機器一天檢測 1100個樣品，而最高峰時達到了7600個。
任務終於按時完成，2001年底研究報告搶在日本之前初稿在《科學》上發表。經最終核算，華大的總成本達1.6億元。在新聞發布會上，楊煥明說:“每分錢都是華大從牙齒縫裡省出來的。”
華大向何處去
《科學》雜誌的封面——雲南紅河哈尼梯田被華大做成了兩副紀念品，一副上面寫有中科院副院長陳竺的題詞“民以食為天”;另一副則刻上了資助單位的名稱: “中國科學院、國家計委、科技部、浙江政府、杭州政府、北京政府、國家自然基金會”。科技部立項後，相繼有政府的投資進入，總計 7000～8000萬元，虧空尚有7000萬元左右。“如果沒有當初的貸款，這筆錢夠了。”於軍說，“事實上這筆國家投入，大部分也還沒到賬。華大現在有很多設備、試劑的錢都沒付。”
胡松年告訴記者，“我們這裡沒有物質激勵，完全是大家想做一番事業，在科學史上留下名字。”於軍說得很坦然，他並不從華大拿報酬，每年華大僅替他報銷10餘萬元的機票錢。他在4月底回美國，安葬黃穀陽後將辭去華盛頓大學的工作，全力投入華大。而像楊煥明已經把自己全部家當都投進去了。於軍向記者談起華大未來的計劃:研究豬基因需要2～3億元，研究雞的基因需要1億元，研究大豆需要2～3億元，研究中國人的多態性需要8億元。這些經費大多沒有着落，甚至華大目前連申請維護專利的資金都不足。
從商業模式上講，華大是一家提供科學服務的公司。它的服務對象包括北京阜外醫院、北京安貞醫院、青島海洋所、武漢紅桃K等機構，收取服務費或分享研究經費。據胡松年介紹，這樣的收入每年在1000萬元左右，利潤約有 30%。另一塊收入是申請國家研究經費，“以前總要上百萬的項目才去申請，現在 20萬的都去做了”。從賬面看，以這兩塊收入去補貼純公益項目，還沒有看到扭虧的可能。事實上華大在不停接觸投資者，希望通過融資渠道解決研究問題。與國內一些大企業也接觸過，但沒有談成。“我們的第一個問題是產權不清;第二個問題是近期看不到賺錢的可能，即使在美國，研發一個藥品還需要10至15年的時間。”於軍說，一個最可行的辦法是:有投資銀行向華大注入資金，購買有市場有產業聯繫的公司，進行重組，最後上市，投資銀行退出。但問題是華大的研究實在太基礎，能直接和他整合到一起的公司微乎其微。
目前華大的生存還主要依靠幾位創辦者的人脈和聲望，老家溫州的楊煥明為華大爭取到了浙江與杭州的政府支持。學術聲望比較高的於軍則四處奔波尋找合作項目，近期他要去一趟東南亞，包括馬來西亞、新加坡和台灣地區，“日本、韓國的水平比較高，不會用我們的。”記者離開杭州前又去了一次華大，胡松年正和於軍8歲的小兒子打羽毛球;於軍有兩個兒子，大的叫越州，小的叫越洋，“這孩子很聰明，智商130。” 胡松年說，“於老師回國後，他們這樣的孩子要面臨新的選擇。”
華大也是一樣。
路加福音:
19:12 “有一個貴胄往遠方去，要得國回來，
19:13 便叫了他的十個僕人來，交給他們十錠（註：“錠”原文作“彌拿”，一彌拿約銀十兩）銀子，說：‘你們去做生意，直等我回來。’
19:14 他本國的人卻恨他，打發使者隨後去，說：‘我們不願意這個人作我們的王。’
19:15 他既得國回來，就吩咐叫那領銀子的僕人來，要知道他們做生意賺了多少。
19:16 頭一個上來，說：‘主啊，你的一錠銀子已經賺了十錠。’
19:17 主人說：‘好！良善的僕人，你既在最小的事上有忠心，可以有權柄管十座城。’
19:18 第二個來，說：‘主啊，你的一錠銀子已經賺了五錠。’
19:19 主人說：‘你也可以管五座城。’
19:20 又有一個來說：‘主啊，看哪，你的一錠銀子在這裡，我把它包在手巾里存著。
19:21 我原是怕你，因為你是嚴厲的人：沒有放下的，還要去拿；沒有種下的，還要去收。’
19:22 主人對他說：‘你這惡僕，我要憑你的口定你的罪！你既知道我是嚴厲的人，沒有放下的，還要去拿，沒有種下的，還要去收，
19:23 為甚麼不把我的銀子交給銀行，等我來的時候，連本帶利都可以要回來呢？’
19:24 就對旁邊站著的人說：‘奪過他這一錠來，給那有十錠的。’
19:25 他們說：‘主啊，他已經有十錠了。’
19:26 主人說：‘我告訴你們：凡有的，還要加給他；沒有的，連他所有的也要奪過來。
19:27 至於我那些仇敵，不要我作他們王的，把他們拉來，在我面前殺了吧！’”
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