靈恩派教會的問題，凸顯出許多福音派教會重理缺情、不冷不熱的不足與缺失。
然而信仰本身有極大部份是超越理性所能了解的，然而基督信仰的獨特性，就是有道成肉身的中保耶穌基督，以及聖靈默示使徒先知所寫下，有神人二性的聖經。
借用陳佐人牧師在芝加哥福音大會專題中的話，沒有中保的一神信仰，不是走向狂熱主義就是神秘主義。他當時是指回教與猶太教，現在想想，對極端的靈恩派也是個合適的提醒。
如果說辨別是否異端的條件，兩千年教會歷史留下了一些歸納（DXJM若覺不夠或不對請再補充）：
1. 三位一體的神論。
2. 神人二性的基督論。
3. 因信稱義的救恩論。
4. 最高啟示的基督。
5. 終極權威的聖經。
前三項比較在古典信經（如使徒信經、尼西亞及迦克敦信經等）中提及，後兩項是近世紀來自稱彌賽亞的假基督越來越多，奇奇怪怪的啟示（胡說八道）層出不窮後，教會所認定的。
再拾陳佐人牧師的牙慧，華人教會注重三一論、基督論、救恩論；不夠注重教會論、末世論和聖靈論，所以有靈恩派教會的問題。
有人開玩笑說：福音派的三一論是「聖父、聖子、聖經」，沒有聖靈的空間；而靈恩派的三一論是「聖靈、聖靈、聖靈」，又太偏重另一面了。
早年第一、二波的靈恩運動，認為聖靈充滿必說方言，才能得救。在救恩論因信稱義上有犯規之嫌。
第三波的靈恩運動，強調神跡奇事（Benny Hinn為何不去醫院醫癌症病人？）個人預言與使徒先知，在我看來，有挑戰基督啟示與聖經權威的危險。
要靈恩不要靈恩派的說法常常聽到，是什麼意思呢？
靈恩若不高舉基督，接受聖經權威，只搞那些擊倒、聖笑、聖嘔吐、知識言語、沙侖玫瑰香、頭上冒金粉、個人預言等聖經沒有的東西，又按一堆使徒先知（理論上是聖經的執筆者、教會的根基），靈恩即使不派恐怕也很危險啊！