Algorithms on Strings, Trees and Sequences: Computer Science and Computational Biology by Daniel Gusfield. 你要看了這本書，那bioinformatics的基本東西都清楚了，當然裡面也沒有把全部的領域都涵蓋了。如蛋白質的3D結構的計算/預測，裡面沒有。

謝謝你的好意，但我認為我不可能對你有什麼幫助。但你的發明，我今後肯定會有機會用到。儘管我搞軟件開發已有20多年，但我是半路出家。而有關算法的書，估計我不比計算機科班出身的看得少。Knuth的ACP我很早就看過（但第四卷的5本去年才到手）。Cormen, Leiserson, Rivest & Stein的introduction to algorithms我買了兩本，都送給朋友（認識的學生）了。還有Udi Menber的introduction to algorithms，我特別喜歡。