Algorithms on Strings, Trees and Sequences: Computer Science and Computational Biology by Daniel Gusfield. 你要看了这本书，那bioinformatics的基本东西都清楚了，当然里面也没有把全部的领域都涵盖了。如蛋白质的3D结构的计算/预测，里面没有。

谢谢你的好意，但我认为我不可能对你有什么帮助。但你的发明，我今后肯定会有机会用到。尽管我搞软件开发已有20多年，但我是半路出家。而有关算法的书，估计我不比计算机科班出身的看得少。Knuth的ACP我很早就看过（但第四卷的5本去年才到手）。Cormen, Leiserson, Rivest & Stein的introduction to algorithms我买了两本，都送给朋友（认识的学生）了。还有Udi Menber的introduction to algorithms，我特别喜欢。