http://wforum.zixia.net/disparticle.php?boardName=Bio_Medi&ID=18386&pos=2

從這份帖子開始，就進入了指南的中心內容了。我決定按US News 上2006 Top Medical Schools 的排名介紹各個學校的生物信息學專業。
在北美，生物信息學被稱為Bioinxxxxatics，類似地，不少大學還建有Computational Biology （計算生物學）, Computational Molecular Biology （計算分子生物學）, Systems Biology （系統生物）, Genomics （基因組學）, Biomedical Science （生物醫學），Quantitative Biology（數量生物）等專業。箇中的區別是有的，取決於不同的研究課題和方向，但是以上的專業大家都可以考慮申請。
我比較推薦申請單獨的博士項目，因為這些項目一般成立的歷史不太久，資金比較充足，所以好申請到獎學金。當然，也可以考慮申請具體的系，如果在這個系有教授從事生物信息方面的研究。
因為生物信息學是一個新興地交叉學科，和醫學，生物結合尤其緊密，所以我打算按照美國的U.S. News的2006 Top Medical Schools排名介紹各個學校的生物信息學專業。雖然排名固然重要，但是申請的時候一定要結合自己的實際情況和研究方向去尋找自己所滿意的學校。
同時，一些建有生物信息學專業的學校沒有醫學院，我也會把它們列舉出來。最後，我也會列舉一些加拿大和新加坡的學校，可能也有申請者會考慮。
首先讓我們來看看U.S. News的2006 Top Medical Schools排名。網站
http://www.usnews.com/usnews/edu/grad/rankings/med/brief/mdrrank_brief.php
列出了前46名。

第1： Harvard

Bioinxxxxatics and Integrative Genomics (BIG) program （http://big.chip.org/）

（1）具體的申請方法請參照 http://big.chip.org/admissions.html
（2）它強調申請者至少要取得工程或者物理或者計算機的本科學位，同時接受過生物，有機化學，物理化學或者熱力學，生物化學和微積分的訓練。
（3）因為BIG program是在Harvard和MIT合辦的Division of Health Sciences and Technology (HST)下面，所以申請者可以通過MIT去申請，也可以通過Harvard申請。

Systems Biology Ph.D.Program in School of Medicine (http://sysbio.med.harvard.edu/phd/index.html)

(1)Harvard去年正式在醫學院成立了Systems Biology系，也開始招收了2005年秋季第一班博士生。系上先有10個正式的faculty，整個PhD項目裡面有22個faculty。值得一提的是，畢業於中科大的Dr.Zhuang （http://zhuang.harvard.edu/），做得非常好。
(2)對Systems Biology感興趣的同學不妨考慮一下。去年好像有北大的同學申請過，不知道最後結果如何。

Biophysics Program (http://arep.med.harvard.edu/biophysics/#dexxxxion)

(1)這也是一個交叉方向，主要是招收有很強物理，化學和數學背景的申請者，同時也接收來自生物和電子工程的申請者。
(2)這個Program也提供Computational Biology的training，具體信息請參見 http://arep.med.harvard.edu/compubio.html

Ph.D. Program in Statistics (http://www.gsas.harvard.edu/programs/degree/stats.html)
Ph.D. Program in Biostatistics (http://www.gsas.harvard.edu/programs/degree/biostat.html)
（1）這兩個Program也值得推薦給學統計和數學的同學。在統計系，Liu Jun教授做得很出色，他建立的實驗室叫生物信息實驗室 （http://www.people.fas.harvard.edu/~junliu/），具體的一些研究方向包括單核苷酸多態性的基因分析，聚類算法，Monte Carlo 算法，優化算法，基因序列研究等。
（2）在生物統計系，也建有專門的生物計算方向，http://biosun1.harvard.edu/research/divisions/compbio/index.html 。Liu Jun教授也在這個系，他以前在Stanford的學生 Dr. Xiaole Liu 也在這兒，主要研究方向是基因序列分析， http://www.hsph.harvard.edu/faculty/XiaoleLiu.html 。



談到Harvard就不能不談談它的鄰居，MIT。值得強烈推薦的是：

Computational and Systems Biology (CSB) Ph.D. Program
（http://csbi.mit.edu/csbieducation/csbphd）
（1）到2006年秋季，是CSB的第3屆招生了，我所了解的是，他們比較傾向於有生物和計算雙學歷的學生。當然，缺一方面背景的話，你一定要在另外一方面非常強。
（2）他們的研究力量很強，教授來自好幾個系。純計算機背景的同學也可以去MIT的EECS系看看他們的CS in Life Sciences 介紹（http://www.eecs.mit.edu/grad/CS-LS.html）。





第2： Johns Hopkins University

Program in Computational Biology (http://www.jhu.edu/~ibr/bwf/index.html)
(1) 申請JHU的計算生物專業需要通過JHU的Program in Molecular & Computational Biophysics 去申請，http://www.jhu.edu/pmb/ 。他們鼓勵有生物，化學，工程，數學，物理的背景的申請者去申請，當然有統計和計算機背景也是歡迎的。
(2) 具體研究方向包括了：
Protein and RNA: Folding, Energetics, and Dynamics
Macromolecular Recognition and Interactions
Membranes and Membrane Proteins
Ribosomes and RNPs
DNA Replication, Recombination, and Repair
Enzyme Mechanisms and Metabolic Pathways
Structure Determination by X-ray Crystallography and NMR
Gene Regulation Mechanisms
New Spectroscopic and Single Molecular Methods
Computational Approaches and Modeling in Biological Systems
Molecular Evolution




第3： Washington University in St. Louis

華盛頓大學的醫學和生物醫學分部 Division of Biology & Biomedical Sciences 一共有12個不同的graduate groups。值得推薦的有：
Computational Biology Program

（http//dbbs.wustl.edu/dbbs/website.nsf/WV/0965C5D46739DD6186256D4F00691262? OpenDocument&DN=1103&C=Graduate+Students&U=C6A57C07D1F1A4AD86256D8600522802）


Molecular Biophysics Program
（http//dbbs.wustl.edu/dbbs/website.nsf/WV/CC0DCAA5385D8CF386256D4F00693804? OpenDocument&DN=1107&C=Graduate+Students&U=BFCA6EDE45235CC586256D8600526202）

Quantitative Human and Statistical Genetics Program
（http://dbbs.wustl.edu/dbbs/website.nsf/WV/56B49122A4F96EF086256F1100641A0B?OpenDocument&DN=1113&C=Graduate+Students&U=B247F85424A7082386256F0F005AB10D）

（1）有統計和數學背景可以考慮申請Quantitative Human and Statistical Genetics Program；有計算機背景可以考慮申請Computational Biology Program；有物理，化學背景可以考慮申請Molecular Biophysics Program。
（2）Computational Biology Program的Director是很有名的Gary D. Stormo, http://ural.wustl.edu/ , 同時Dr. Sean Eddy也非常出名，是Biological Sequence Analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids一書的作者之一 ，http://selab.wustl.edu/ 。 有計算機背景的同學為了增加錄取機會，也應該考慮同時申請Dept. of Computer Science and Engineering，http://www.cse.seas.wustl.edu/ 。在CSE，目前有三個教授從事Computational Genomics的研究，Michael R. Brent，Jeremy Buhler，和Weixiong Zhang,
http://www.cse.seas.wustl.edu/ComputationalScience.asp 。
（3）Quantitative Human and Statistical Genetics Program是2005年秋季第一次招生，具體研究方向請去它們的主頁瀏覽。
（4）強烈推薦大家申請盛頓大學的醫學和生物醫學分部 Division of Biology & Biomedical Sciences下屬的12個研究小組，理由是它們的研究的確非常強，還有就是在每年12月1號前能把申請資料寄到的話，申請費可以被waive掉，也能節省幾十美刀啊，呵呵。不過，這裡是非常難申請到的，祝大家好運!