上文略略談到了宗教對科學發展的促進作用。我們可以看到，如果沒有人們的宗教熱情，科學的產生近乎不可能。即使是現代科學的產生也是如此。因此，可以說，宗教實際上是孕育科學的“母體”，也是現代科學的助產士。

科學和宗教的作用不同，分工有別，科學關心的是對自然界的理解，而宗教關心的是人性道德、倫理和精神需要。因此，二者不是對立的，而是互補的。它們之間的對立是人為造成的，或者說，是由於人的無知和有限而造成的。

科學晚於宗教，這是不爭的事實。在古代，人們對自然的認識能力低下，獨立的科學不可能產生。那時 的科學胚胎實際上還孕育在宗教和哲學體系之內。比如，煉丹術就是化學的原始形態，占星術則是原始天文學的一種形式，養生修煉之法是醫學的萌芽。這個事實起 碼說明了一點，宗教熱情和衝動曾經是人類探索自然奧秘的動力。埃及--巴比倫的神廟，具有神秘宗教性質的畢達哥拉斯學派，伊斯蘭教宗在巴格達所建立名為“ 智慧之家”的科學研究所，以及中古時期從教會學校演變而來的大學，等等，無一不和宗教有關。

宗教對現代科學的產生也起到了很重要的促進作用。至少在16世紀之前，有系統的科學還沒有產生，而宗教則一直在人們的生活中占據着重要地位。到了17世紀，出現了真正的具有現代意義上的科學。

現代科學的產生也得益於宗教改革浪潮，它產生於16和17世紀文藝復興和宗教改革後的歐洲。正是 文藝復興和宗教改革解放了人們的思想，使得科學研究可以放開手腳。宗教為科學研究確立了價值和目標，而宗教熱情促使一大批著名科學家從事自己的科學研究。 近現代許多著名科學家，如科卜勒、牛頓、萊布尼茨、普朗克、海森堡、愛因斯坦等都是懷着巨大的宗教熱情從事科學研究的。德國著名科學家、量子力學的奠基人 普朗克在談到宗教對科學的作用時這樣說，“宗教和自然科學是珠聯璧合、相得益彰的。”“宗教給生氣勃勃的信徒灌輸一種純真樸實、專一堅毅的信仰，從中迸發 出一種無比強大的力量，衝擊他們去取得輝煌的創造性成就。”愛因斯坦則認為，“宇宙宗教情感是科學研究最強有力、最高尚的動機。”“很難在造詣較深的科學 家中間找到一個沒有自己宗教情感的人。”

人們常常提到的科學與宗教衝突的兩大典型案例，一是伽利略受審案，另一個是上帝創造說與達爾文進化論的論戰。

羅馬教廷對伽利略的審訊，目的是為了維護傳統的托勒密宇宙模型。這種宇宙模型認為，地球是宇宙的 中心，所有的天體都圍繞着宇宙旋轉；而伽利略公然支持哥白尼學說，因而受到了教廷審判。哥白尼學說認為，太陽才是宇宙的中心，所有天體都在圍繞太陽旋轉。 二達爾文進化論認為，所有物種，包括人類在內，都是原始生物經過漫長而複雜的進化過程達到的。達爾文進化論強調物種的“自然選擇”，與基督教思想中的神創 論相矛盾 。

曾任美國卡爾頓大學教授和宗教學教授的伊安-巴伯在其《當科學遇到宗教》中認為，上述兩個案例反 映的並不是科學與宗教的衝突，而是科學唯物主義與聖經直解論的衝突。科學唯物主義認為，組成世界的只有物質實在，不存在心靈實在和精神實在，科學方法是探 究物質實在的唯一方法。聖經直解論者則堅持按照字面意義理解《聖經》，往往把科學的新發現、新理論，尤其與《聖經》不符合的科學發現、科學理論視為是對上 帝信仰的挑戰。巴伯認為，只要把聖經直解論排除在基督教之外，許多原本所謂的科學與宗教的衝突就不再是真正意義上的科學與宗教的衝突了。

《聖經》是關於神的啟示和人類對上帝信仰的一部書。但是《聖經》只是對“啟示”的見證，而神在《聖經》中的啟示是漸進的，一步一步的啟示。約翰-加爾文就認為，《聖經》的語言“遷就”讀者的有限知識，以確保讀者能夠正確理解其道德要求。耶穌就曾多次說：“有耳可聽的，就應當聽！”他所講的，除了比喻以外，都是淺顯易懂的道理。需要指出的是，聖經不是一部科學著作，但是卻隱含了許多科學的啟示。

單單就羅馬教廷對伽利略的審訊這件事來說，也不能完全理解為科學和宗教衝突的結果，或者宗教迫害 科學的例證。事情其實並不那麼簡單。事實上，伽利略自己就是一個虔誠的天主教徒，他一直和教宗烏爾班八世（Pope Urban VIII）保持着相當密切的關係，而這位教宗也一向以支持藝術和科學為榮。他們之間的友好關係一直持續到17世紀30年代初期。一開始，伽利略的研究獲得 了教宗的默許，只要他不偏不倚地對待哥白尼的宇宙體系並將之視為假設，他就可以繼續從事他的研究、探索和著述。但是，伽利略1632年出版了《兩大宇宙體 系的對話》（Dialogo sopra i due massimi sistemi del mondo），違反了這一限制。教宗因此懷疑伽利略悖逆，並出賣了他們之間的友誼。烏爾班受到了來自西班牙的壓力，要求他對持有異端邪說嫌疑的人不要寬 容，因此，同年10月，伽利略接到命令，到羅馬接受教皇審訊。伽利略的學說被定為異端，他本人遭到軟禁。但是這種軟禁有限度的，伽利略仍然享有一定的人身 自由，可以出外旅行，並接見來訪者，直到1642年因病去世。

至於達爾文的進化論，直到現在還只能算是一種假說。進化論認為，一切生命都是由單細胞生物演變成為多細胞生物，並經過進化而來的。但是目前比較解剖學、胚胎學以及生物地理都發現了很多反證，證明進化論難以成立。

進化論認為，地球上的所有生物都是受基因的突變影響而不斷演變的，並在自然環境的選擇下經過自然 淘汰，使適合生存的生物存活下來，劣質的被淘汰。研究證明，這些理論是錯誤的，因為百分之九十以上的基因突變都是有害或致死的，不可能造成生命的演變與存 在。同時，根據熱力學第二定律，一種物種可能橫向發展，例如雞種可以分為各種品種的雞，毛色各有不同，但它們基本上都是雞，不可能由雞轉向另一種生物。更 不可能出現縱向轉變，比如由低等動物變成高等動物。此外，達爾文自己也承認，有些器官，比如眼睛，其結構如此精密，是無法由進化產生的。還有，直到目前為 止，還沒有發現任何化石可以解釋達爾文進化序列的中間環節。比如，迄今為止，還沒有發現一具完整的人猿化石，而圍繞這種中間環節卻出現象“皮爾當人”這樣的著名騙局。

1912年，一位名叫查爾斯-道森的職業律師有了一項驚人的發現，他也因此成了英國人心目中的民 族英雄。達爾文進化論風靡全球以後，科學家們急於發現從猿到人進化的過渡形態，但卻遲遲未能如願。而道森的發現正好填補了“缺失的一環”。他“發現”的皮 爾當人的頭骨化石――頭蓋骨像人，下頜骨像猿，正好填補了這一空白。不過，在它被發現的45年之後，皮爾當人化石被宣布為人工偽造的化石，成了當年最轟動 的“英國醜聞 ”。

從科學的發展史來看，一種嶄新理論提出以後，往往要經過很長一段時間，才能令人信服，被人接受。 用事後諸葛亮的方式譴責宗教學家的抗拒當然很容易，但是人們應該認識到，宗教學家是人，而不是神。他們在接受一種新學說時表現出小心翼翼態度是可以 理解的。因此，如果說二者存在對立，這種對立也是由於人的無知和有限而造成的。科學家從事科學研究需要信仰的引導和支持，否則就可能出現“皮爾當人 ”一類的學術造假。或者為了某種利益就任意誇大某些發現的科學價值，或者縮小甚至隱瞞某 些發明的副作用。最近剛剛看到一則報道，美國製藥巨頭輝瑞公司因為故意誇大藥品作用、邀請醫生打高爾夫、按摩、度假等不當手段推銷了13種藥物，以此被罰 款23億美元巨款，來換取司法部撤銷對它的指控，就很能說明一些問題。