對於“蛋白質研究計劃”的立項過程以及研究內容，我是非常清楚的（不好意思，我參與了內容的修訂）。對於研究內容，我沒有什麼意見，因為我的研究水平和眼界也就這樣；大概海外華人科學家也不會把它貶低到毫無是處，畢竟計劃還是緊扣當前生物學研究的熱點和難點的。

那麼為什麼海龜們要極力反對而國內的權威們卻眾口一詞趨之若騖呢？

中國的科技為什麼落後於西方？怎樣儘快提升國家的科技創新能力？這次海外華人科學家反對所謂的“蛋白質計劃”，如果放在一個更大的歷史環境裡，就會明白恰恰是擊中了中國落後的要害，同時也開出了良方。

無論發展科技、教育、經濟、文化還是其他事業，決定性的因素只有三個：體制、人、錢，而且前者重要性大於後者。華人科學家反對這項計劃，主要反對的就是這項計劃所折射的科技管理體制（包括科技立項、項目申請、財務管理、學術評價等），而不是反對其研究的內容。關於這方面的意見，各位朋友可以參考最近Nature雜誌為中國出的專刊，其中多位牛人都毫無例外地指出了中國發展科技地最大障礙在於其體制，而不在於人和投入資金。饒毅老師也多次在國內媒體（包括《南方周末》）載文指出國內科研體制的弊端是首害。

推廣開來，中國從明朝開始在文明進步的競賽中落後於西方的最大原因和今天依然落後的最大原因仍舊相同：都是由於我們落後的體制。洋務運動失敗了，因為它只看重船堅炮利（也就是今天做研究的儀器設備，都是看得見的東西）；好不容易來個戊戌變法想對體製做點改動，想不到又被那個慈谿老太婆給滅了，要不中國說不定也像日本明治維新中興了。直到今天，我們進行的改革開放，仍舊是破除這些落後的體制。

但是，我們的改革開放卻局限在經濟領域，對政治體制改革，也就是對上層建築的改革卻停滯不前。從根本上講，科研體制是一種上層建築。中國科研管理的運作模式和25年前並沒有區別，都是行政決定科研，行政管理科研。如果這種體制大行其道的話，怎麼能創造世界科技強國的中國？儘管自然基金委的課題申請已經比較公開和公正了，但它的份量還是太小了，所占的經費太少，才不過20億。

這次國家中長期科技規劃下有許多子課題（總計17個，其中一個是基礎研究計劃），蛋白質研究計劃還只是屬於基礎研究計劃中的一個！！按照目前的進程，將來國家中長期可以規劃都由科技部統管，類似於973和863。看看973和863的狀況，其實也就知道這個計劃將來的命運。

可憐，我們國家捉襟見肘的研究經費就被科技部幾百個小官僚掌握着，並間接掌握着中國數以萬計的研究人員的命運以及中國科技的命運。大家認為正常嗎？

科技部的職責根本就不應該管錢，而是管政策，最多管管規劃。