以色列方面指責伊朗在敘利亞的軍事存在威脅其國家安全，其中一個重要理由，就是以色列不斷向敘利亞輸送高技術武器，包括彈道導彈、巡航導彈、遠程火箭彈和無人機等，甚至還在敘利亞建設了多個導彈組裝工廠，但根據公開報道看，伊朗方面並未從敘利亞境內向以色列發射導彈或無人機，僅曾炮擊過戈蘭高地上的以軍，倒是敘利亞防空部隊在發射S-200防空導彈攻擊以色列戰機的時候，被以色列發射的防空導彈擊落，S-200導彈的殘骸落到了以色列境內。

以色列方面還指責，伊朗通過敘利亞做中轉，將大批武器提供給黎巴嫩真主黨武裝等代理人，以色列方面以此為藉口，不斷空襲敘利亞境內的伊朗武裝基地、軍火庫和導彈工廠，敘利亞境內的伊朗武裝承受了以色列空襲的大部分火力，相比之下，以色列空軍對敘利亞境內真主黨武裝的空襲力度並不頻繁。

近日，以色列商業衛星公司再次公布了多幅衛星照片，顯示敘利亞北部阿勒頗附近的薩菲拉導彈工廠在空襲後遭到了重創，9月11日，這裡的伊朗導彈工廠再次遭到以色列空軍空襲，以色列方面的消息顯示，薩菲拉的工廠主要是為真主黨組裝導彈，工廠的兩棟主要建築遭到了破壞性攻擊，其中一棟建築很可能因為內部儲存的炸藥殉爆而被夷為平地。

以色列情報部門聲稱，近期對敘利亞境內伊朗導彈工廠的空襲，主要是為了減緩其生產速度，按照以色列方面的說法，伊朗通過敘利亞向黎巴嫩真主黨提供了大量高技術武器，這也是真主黨頭目哈桑·納斯魯拉宣稱該組織擁有數萬枚導彈的原因（很可能將火箭彈也算進來了），不過，真主黨武裝近年來主要在敘利亞境內，作為伊朗武裝的一部分幫助敘利亞政府軍作戰，幾乎從未有任何公開報道顯示其跟以色列方面有過直接軍事衝突，這一點跟巴勒斯坦哈馬斯、傑哈德完全不同：後者不時向以色列居民區發射大量火箭彈，隨後又在以色列的猛烈空襲下主動停火。

問題來了，真主黨武裝從伊朗方面接收的大量導彈去了哪兒？推測很可能是作為戰略儲備隱藏在秘密軍火庫，但真主黨武裝與德黑蘭之間並非絕對的隸屬關係，真主黨方面一直試圖提高其獨立性，擺脫德黑蘭的空襲，甚至為此遭到過伊朗革命衛隊聖城旅前指揮官蘇萊曼尼的打壓，伊朗方面交給真主黨的軍火，很可能並沒有那麼多，大部分運抵敘利亞以及在敘利亞製造的軍火，很可能都毀於以色列空襲。