1。正因为并不是所有的ERV出现在不同物种的同一个位置，所以不是所有的ERV都能被用作标记。PERV就不能用作标记。
2。我讲的不是很清楚，更准确的说法是ERV本身没有功能，可是当嵌入宿主的染色体，ERV有时能影响宿主基因。我说的ERV (K-HERV) 非常稳定，是由于它对宿主没有危害。
3。虽然ERV很复杂，但是K-HERV的进化树规律非常清晰。

PERV没有同位嵌入的现象 （The authors compared the sites of viral integration in each of these primates and found that few if any of these insertion sites were shared among the primates.），正好说明这个ERV并不是在灵长类的祖先身上出现的 （This undermines the notion that an ancient infection invaded an ancestral primate lineage）。这是一个特殊的ERV,其形成机理有待研究（在你省略的一段话里）。这才是这篇文章的意思。