我們在煙酒基因機器功能的時候,發現,每個基因編碼的蛋白具有很多的功能性MOTIF。比如梅蛋白具有催化功能區,結合蛋白具有BINDING 區。
這些區域大多在某一類型,也叫做同工基因或者同工基因雅興上在序列上高度的保守,甚至從人到低等原蟲都保守。做蛋白晶體3D SIMULATION的時候,可以把這些區域單獨的切下來表達,其結構和原始的野生態很接近,但更容易長成晶體。
最近的一些煙酒表明,在被普遍認為相當低保守的蛋白N端也具有很多這樣的功能區,而且很多是ALLOSTERIC的。目前很多大藥廠也在猛攻這些ALLOSTERIC的靶點藥物,包括梅類和獸體類,嘿嘿。
其中一個中藥的N端MOTIF就是蛋白磷酸化位點。很有意思的是,我們最近的煙酒發現,一些特定的蛋白雞梅磷酸化的位點不但是特異的,而且為了獲得這些特異的序列,一些基因的亞型甚至可以食用所謂的:超篩選機制SUPERSELECTION 食用DNA編碼氨基酸的不對稱密碼來實現核酸序列的低保守甚至是第一編碼核酸的低保守而蛋白序列的完全一致,也就是說:為了獲得某些特定的MOTIF來實現某個蛋白雞梅在某個特定的N端部委,A1和A2兩個亞型的基因使用了完全看起來不同的--不是第2和第3密碼子突變的機制而是第一密碼子突變的機制來特異的獲得該MOTIF在氨基酸水平的完全相同,也就是說A1和A2如果做基因的核酸阿來門特的時候,在這段區域絕對的完全低低的保守,甚至不能用密碼2-3位的通用性來獲得保守,但其氨基酸序列卻完全相同。也就是說A1和A2在這些部委的基因外顯子看起來完全是不同源的,雖然A1和A2其他部委特別是C端完全的同源和高度的保守。
這就說明:A1和A2在這個MOTIF上企圖獲得同樣的被磷酸話功能,而該磷酸話功能對A這個蛋白的功能可能是決定性的。也就是說所謂的基因突變的篩選是:超篩選的,不是隨機的,而是對應某種功能的。
更絕的是:可以磷酸化這些功能蛋白的蛋白雞梅本身的編碼設計和表達,也是MATCH的,也就是說:二者是可以共同的CO-LOCALIZATION 的,甚至可以通過一些斯蓋佛蛋白來實現共存在共工作。
而且,PPase也和她們一起工作,嘿嘿。