如果从本体论和方法论角度分析，中医是以关系、功能、过程为本体，而不是以实体、形态、结构为本体，是以无形的元气为本体，而不是以有形的原子为本体；中医采用模型方法、感应综合方法、类比方法，而不是原型方法、因果分析方法、还原方法。总之中医学的世界观、生命观是众所周知的整体恒动观。中医一开始就将人视为天地人大环境中的一个子系统，将人体本身视为一个有机的整体，看成是与天地自然相感应的小环境、小宇宙。这是符合人体生命实质的。西方将人看成是机器，18世纪法国唯物主义的开创者J.O.拉美特里即明确提出“人是机器”，但人毕竟不能象机器那样随意拆卸、组装，人除了自然属性、物质属性（包括器官、细胞、分子等组织结构）外，还有社会属性、文化属性、精神心理属性。中医在系统把握人的社会、文化、精神心理属性方面更有其优势。中医阴阳五行、脏象经络学说所采用的整体类比、感应综合的方法，与因果分析方法相比较，后者在解释自然、生命中的确定性、稳定性、线性、高同质性、简单性领域有其优势，而前者在解释自然、生命的不确定性、不稳定性、非线性、低同质性、复杂性领域有其优势。德国著名医学哲学家满晰驳博士（Dr.Manfred  Porkert）说：“物质的客体的同质性在基本粒子中品位最高，从它们开始，沿着原子、分子、细胞、原始的和较高的有机体的组织、动物、人……这一方向行进下去……其同质性依将下降。”“同质性与个体的复杂性成反比”，“功能的稳定性与物质的同质性成反比”，“由于物质客体的同质性不断地减少，基于因果分析的表述最终失去了它的意义。”因此以现代医学为代表的因果分析的方法的作用“在人类生理学的领域里显著削弱了，而且，当涉及到心理的或社会的现象时，它就蜕变成完全不确定的了。”而在这一方面，中医学的感应综合的方法则有它的优势。