1航线控制子系统：有了实时位置和目的港，可算出一个粗略航线。根据天气和海洋预报，修正粗略航线，避开台风和巨浪海区，算出一个精确航线。根据精确航线，电脑自动控制船舶的舵改变航向。由于天气和海洋预报是经常变化的，所以电脑的航线控制子系统需要经常检查预报。如果预报改变，就要重新算。

2航速控制子系统：航线控制子系统给出了精确航线后，根据航程距离和到港要求时间算出航速。航速控制子系统自动控制螺旋桨转速来达到要求的航速。

3船舶安全子系统：船舶安全子系统保证船舶风吹浪打时不会翻掉。这系统要时刻采集风速风向，浪高浪向和波长。还要采集各船舱的装载变化，因为装载变化会改变船舶重心。重心太高，船就容易翻。燃油舱，饮水舱，污水舱的装载，都是时刻变化的，因为它们时刻都在用。有了风浪和船舱装载参数，船舶安全子系统就能评估出船舶安全性。如果安全性不好，船舶安全子系统就会做出改进决策。改进措施通常是调整航向：迎风迎浪船会更安全，横风横浪船会更危险。有时也调整航速。调整航速可以改变船舶在海浪里的遭遇频率，让它避开船舶固有频率，以免共振。