我和职老的最根本的分歧是物种之间有没有血缘关系。 我在前面的文章里讲了一个病毒的DNA嵌入host的染色体的例子来说明人和黑猩猩源于共同的祖先。其实这个故事我还没有讲完，在这里做一些补充。 我要讲的病毒叫反转录病毒（retrovirus)。这种病毒很特别，它的遗传密码载在RNA而不是DNA上。当它侵入host，它的RNA会反转录成DNA，同时把病毒的DNA嵌入host的染色体并留在那里。如果病毒侵入host的卵子或者精子，嵌入host染色体的病毒DNA就会在染色体相同的位置上一代一代地传下去。嵌入host染色体的病毒DNA叫做ERV。科学家在人以及很多动物的染色体上都发现了许多ERV。这些ERV没有任何功能，只不过是病毒遗留下来的残片。 科学家发现人的ERV在其他的灵长类动物里也有，而且在染色体上相同的位置上。在一项研究中（Ref. 1)，科学家发现ERV可以按照DNA序列分成几个类型：第一类在所有他们研究的灵长类（人、黑猩猩、大猩猩、长臂猿、旧大陆猴）里都有，第二类只出现在人、黑猩猩、大猩猩、长臂猿身上，第三类只出现在人、黑猩猩、大猩猩身上， 第四类只出现在人和黑猩猩身上， 第五类只出现在人身上。 有趣的是，相应的ERV嵌入染色体的位置在不同的物种里完全相同！ 对这个结果最合理的解释是：第一类ERV侵入的host是所有这次研究的灵长类的共同祖先，第二类ERV侵入的时间晚一些，在猴子和猿分道扬镳之后, 侵入了人、黑猩猩、大猩猩和长臂猿的共同祖先。第三类ERV侵入了人、黑猩猩和大猩猩的共同祖先， 第四类ERV侵入了人和黑猩猩的共同祖先。 第五类ERV侵入人的染色体，时间要晚得多，在人和其他灵长类分道扬镳之后。 这和从解剖学以及基因组分析得到的进化树是完全一致的。 试想如果得到的结果不遵循这个规律，比如一种ERV出现在旧大陆猴和人身上，但不出现在黑猩猩身上，那么进化的学说就有问题了。可是这样的情况根本就不存在。 后来这个结果被其他的科学家证实 (Ref. 2)，而且更多的人和黑猩猩共有的ERV被发现（在染色体上相同的位置上, 仅K类至少就有16个！）。 那么有没有可能病毒分别侵入人和黑猩猩，分别嵌入人和黑猩猩的染色体，正好嵌入了同一个位置？有人用统计方法计算了一下，16个K类ERV一起嵌入这两个物种染色体的相同位置的概率是2x10^138! 所以这些ERV分别嵌入人和黑猩猩的染色体同样的位置几乎是不可能的。请看一个短片: http://www.youtube.com/watch?v=TUxLR9hdorI 职老会说：ERV不是随机的嘛，是上帝做的。 那么请问，为什么上帝要把没有任何用处的ERV这么有规律地嵌入不同物种的染色体里？是为了好玩造一个进化树？ 当然，职老总是能找到说辞的。可是他拿不出任何证据证明自己的论点。他的逻辑是，你只要不能否定上帝的存在，那么你的论断就肯定是错的。所以和他辩论没有什么意义。这篇文章不是写给职老的，而是写给想了解进化论的读者们。进化论不是我的科研领域，欢迎指正和补充。 Reference: 1. Medstrand, P and Mager, D.L. (1998) J. Virology 72:9782. 2. Hughes, J.F. and Coffin, J.M. (2001) Nature Genetics 29:487.