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我举报:中国科学院副院长陈竺欺骗中国公众
·方舟子·
《人民日报》2001年10月15日第六版刊登了一篇题为《中科院肯定我国水稻物
理图谱研究》报道,称:
“洪国藩院士于1997年构建的水稻基因组物理全图,属于原始性的突破,
我们不能否定它在科学发展中的贡献。”日前,在中国科学院、国家计委、科
技部联合召开的“中科院完成水稻基因组工作框架图新闻发布会”上,中科院
副院长陈竺对我国水稻物理图谱研究给予了正面评价。
……陈竺同时以华大基因中心杨焕明等人最近做的研究,为洪国藩院士等构建
的水稻基因物理图谱的准确性“正名”:“他们共选择了经精确测序的8个基
因片段与物理图谱进行对照,覆盖率超过了95%。”
在读了这篇报道之后,我以及几位从事基因组研究的专家,都认为仅仅选择了
8个基因片段这么小的样本进行对照,是难以为洪国藩的物理图谱正名的。这也许
还勉强可算是学术争论。但是,我万万没有想到的是,中国科学院的副院长竟然会
当众撒谎:并不是样本选得太小,而是根本就没有与洪国藩的物理图谱做过对照。
这一次的新闻发布会,公布的是华大基因中心所做的“籼稻9311”基因组
工作框架图,本来与洪国藩的工作无关。根据《南方周末》2001年10月18日的有关
报道,以及我向几名参加了这次发布会的人士进一步了解:洪国藩虽然被邀请参加
这次发布会,但一直默默地坐着,没有发表任何意见。会议也一直没有提到洪的工
作,直到快结束时,才有记者问到应该如何评价洪国藩等构建的水稻基因物理图
谱,陈竺回答说:他读了华大基因中心关于水稻基因组工作框架图的论文,发现
“他们共选择了经精确测序的8个基因片段与物理图谱进行对照,覆盖率超过了95%。”
也就是说,陈竺并没有内部资料,根据的是华大基因中心的论文。这篇论文已
发表在《科学通报》杂志电子版上(http://www.scichina.com/ky/0123/ky1937.stm)。
这篇论文是关于“籼稻9311”基因组文库的。水稻基因组的长度大约为430 MB
(MB为DNA序列的长度单位,即百万个碱基),这个基因组工作框架图的长度为
409.76 MB,表明它对水稻基因组的覆盖率达到95.29%。为了验证这个结论,研究
者用另外两种水稻基因组文库的序列做了比较:一、从“籼稻广陆矮”基因组BAC
文库挑选了8个已经完成测序的克隆,总长度为650 kb (kb表示千个碱基),除去
41 kb的重复序列后,发现有590 kb可以在该工作框架图上排列对比(alignment),
覆盖率为96.82%。二、从日本粳稻基因组BAC文库挑选了8个已经完成测序的克隆,
总长度为518 kb,除去重复序列后,发现有518 kb可以在该工作框架图上排列对比,
覆盖率为95.75%。
洪国藩的物理图谱用的是“籼稻广陆矮”基因组BAC文库,陈竺所谓“选择了
经精确测序的8个基因片段与物理图谱进行对照”,显然指的是上述第一个验证。
然而,这是从“籼稻广陆矮”基因组挑选了8个已测序的片段来验证“籼稻9311”
基因组框架图的覆盖率,和洪国藩的“籼稻广陆矮”基因组物理图谱没有任何的关
系。覆盖率在95%以上指的是“籼稻9311”基因组框架图,而不是洪国藩的物理图
谱。通过这个验证,丝毫也不能说明洪国藩的物理图谱的任何情况,因为它和这个
物理图谱完全没有关系。洪的物理图谱即使完全错误,也同样可以做类似的验证和
得到同样的结果,因为所需要的只是单个克隆的准确序列,而不需要知道各个克隆
是如何组装的(此即所谓物理图谱)。
这是只要具有分子遗传学的知识就能明白的道理,身为主管中科院生命科学研
究的副院长,身为南方国家基因组中心负责人的陈竺院士不会不明白。那么,为什
么罔顾事实,欺骗公众,欺骗上级领导,用中国科学院的名义不择手段地为洪国藩
的物理图谱“正名”?中国科学院副院长陈竺院士在这一事件上的所作所为,已丧
失了做为一名科学家对科学问题所必须具有的诚实态度,极大地败坏了中国科学院
的声誉。我谨向中国科学院学部科学道德建设委员会举报,要求认真调查和严肃处
理这一违背科学道德、以中科院的名义欺骗公众的事件。
2001.11.15.
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